摘要【背景和目的】<br> microRNA-221-3p(miR-221-3p)和microRNA-222-3p(miR-222-3p)均为小分子非编码RNA,能在转录后水平调控靶基因信使RNA(messengerRNA,mRNA)的翻译,调节蛋白质的合成,两者均定位于X染色体,拥有相同的转录本和种子序列,具有高度同源性。最近的研究证实,miR-221/222-3p的异常表达与多种恶性肿瘤的发生发展密切相关,并且在乳腺癌中也起到促进肿瘤生长和侵袭的作用,但其作用机制以及临床意义仍需进一步研究。在本研究中我们探索miRNA-221-3p/222-3p在乳腺癌中的表达与临床病理特征的相关性和诊断价值,以及通过公共数据库分析其预后价值。基于生物信息学预测其下游的靶基因和信号通路,为乳癌的诊断、预后预测提供潜在的分子标记物和治疗靶点,并为其在乳腺癌进展中的作用机制提供理论基础。<br> 【材料和方法】<br> 选取汕头大学医学院附属肿瘤医院乳腺中心2019年1月至2021年5月的70名女性乳腺癌患者的癌组织和匹配的癌旁组织,通过实时荧光定量PCR(quantitativereal-timePCR,qRT-PCR)检测乳腺癌组织和癌旁组织中miR-221/222-3p的表达水平,并分析miR-221/222-3p的表达与临床病理特征之间的相关性;通过受试者工作特征(receiveroperatingcharacteristic,ROC)曲线评估其诊断价值;通过分析来自癌症基因组图谱数据库(TheCancerGenomeAtlas,TCGA)的766例乳腺癌患者数据,绘制Kaplan-Meier曲线和通过Cox回归分析,分析其在预测预后的价值。通过网络数据库预测miR-221/222-3p的下游靶基因,并对靶基因进行基因本体论(GeneOntology,GO)和京都基因和基因组百科全书(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes,KEGG)通路富集分析,以预测参与乳腺癌进展的潜在信号通路。随后,将靶基因上传到Metascape以进一步构建蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)网络并筛选与miR-221/222-3p相互作用关系最强的关键基因。<br> 【结果】<br> miR-221-3p在乳腺癌组织中表达水平显著高于配对癌旁组织(3.09±5.17VS1.00,p=0.038),miR-222-3p在乳腺癌组织的表达相对癌旁组织有升高趋势,但差异无统计学意义(2.19±3.60VS1.00,p=0.860)。miR-221/222-3p在三阴性乳腺癌(triple-negativebreastcancer,TNBC)组织中表达水平均显著高于其他分子分型乳腺癌(p<0.05)。miR-221-3p的在雌激素受体(estrogenreceptor,ER)阴性和孕激素受体(progesteronereceptor,PR)阴性的乳腺癌中表达水平均显著高于阳性表达组(5.82±6.98VS1.93±3.68,p=0.003;4.90±6.55VS2.02±3.85,p=0.022),miR-222-3p的在ER阴性和PR阴性的乳腺癌中表达水平也显著高于阳性组(4.86±5.19VS1.04±1.73,p<0.001;4.02±4.97VS1.10±1.81,p=0.009)。miR-221/222-3p表达水平与患者年龄、肿瘤大小、淋巴结状态、ki67表达、肿瘤的分期无相关性(p>0.05)。通过ROC曲线分析,miR-221-3p的AUC为0.799,在截断值为12.89时,敏感性为91.7%,特异性为66.7%(p=0.013);miR-222-3p的AUC为0.764,截断值为12.02时敏感性为83.3%,特异性为75.0%(p=0.028),结果显示miR-221/222-3p对TNBC具有诊断价值。生存分析结果显示miR-221-3p高表达组的5年OS、DFS均低于低表达组(75.9%VS84.4%,HR=2.08,p=0.037;73.6%VS83.4%,HR=2.07,p=0.039);miRNA-222-3p高表达组的5年OS、DFS均显著低于低表达组(72.5%VS84.5%,HR=3.48,p=0.002;68.3%VS83.8%,HR=2.33,p=0.003)。Cox回归分析显示miR-221/222-3p的高表达是乳腺癌不良预后的独立因素。通过对靶基因进行GO和KEGG通路富集分析表明,miR221/222-3p参与MAPK信号通路调控乳腺癌的发生和发展。基于PPI网络筛选的与miR-221/222-3p相互作用关系最强的前10个关键靶基因为FOS、CDKN1B、CTCF、ETS1、BCL2L11、DICER1、TCF12、KPNA2、ARID1A、YWHAG。<br> 【结论】<br> (1)miR-221-3p在乳腺癌组织表达显著增高于癌旁组织;<br> (2)miR-221/222-3p在ER、PR阴性乳腺癌和TNBC中表达水平显著增高,可作为TNBC潜在的诊断标志物;<br> (3)miR221/222-3p的高表达与乳腺癌的不良预后相关,可作为预测乳腺癌不良预后的因素;<br> (4)基于生物信息学预测的关键靶基因和MAPK信号通路可能是miR-221/222-3p参与调控乳腺癌进展的潜在机制。需要进一步通过实验探索它们在乳腺癌中的作用机制。<br> (5)miR-221/222-3p与关键靶基因FOS、CDKN1B、CTCF、ETS1、BCL2L11、DICER1、TCF12、KPNA2、ARID1A、YWHAG可能存在相互作用关系。
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