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摘要鸡肫梅花草（ParnassiawightianaWall.exWightetAm.）是梅花草属分布于中国-喜马拉雅地区的古老种，地理分布跨越我国三大植物热点地区，呈现明显的间断分布，是研究高山植物类群谱系地理结构的理想材料，在观赏、药用及化学产品开发上还具有极大的潜力。本研究使用三个叶绿体基因（cpDNA）片段（rpl32-trnL、trnL-F、trnS-G）和一个核基因（nDNA）片段（ITS），探究鸡肫梅花草遗传多样性以及谱系结构，结合最大熵模型（MaxEnt），利用历史时期的环境变量数据，共同推测种群历史动态、迁移路线以及避难所位置。本研究的主要结果如下：<br>　　（1）三个cpDNA联合片段总长度为1830bp，检测出55个信息位点，26个单倍型，总遗传多样性Ht=0.885，遗传分化系数Fst=0.962；ITS片段长度为344bp，检测出47个信息位点，拥有36个单倍型，总遗传多样性Ht=0.980，遗传分化系数Fst=0.961；鸡肫梅花草存在谱系地理结构，种群未经历近期扩张事件，遗传变异主要存在于群体之间；<br>　　（2）鸡肫梅花草符合“冰期扩张-间冰期收缩”模式，从末次间冰期至今，鸡肫梅花草分布范围保持稳定，推测可能是沿着山脉在高海拔与低海拔之间往返，并未表现出水平方向上明显的扩张或者收缩；在横断山脉、武陵山区、秦岭和大巴山地区存在多个避难所；<br>　　（3）鸡肫梅花草存在两条主要的迁移路线，均以青藏高原东南部的横断山区为起点，一条向西沿喜马拉雅山脉进入高原台面，一直到青藏高原西部；另一条则向东经云贵高原、武陵山区，然后以巫山、大娄山等作为通道向北迁移，最后抵达秦巴地区。<br>　　综上所述，本研究基于分子标记和MaxEnt模拟，探究了鸡肫梅花草的谱系地理结构和种群历史动态，推测出了其迁移路线和避难所位置，为其它类型的物种谱系研究提供了参考，也为鸡肫梅花草野生资源保护及开发利用提供了重要的科学依据。