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结合公共数据库分析ADHFE1在胃癌中的表达和意义

摘要目的:结合数据库与基础实验分析ADHEF1在胃癌中的表达及其临床意义。方法:收集2020年10月至2021年10月期间于内蒙古医科大学附属医院行手术治疗的胃癌患者手术标本,其中胃癌组织及配对癌旁组织共32对。采用免疫组织化学染色方法检测胃癌中ADHFE1蛋白的表达情况并分析ADHFE1蛋白的表达和临床病理特征之间的关系。选取15对冰冻组织样本进行qRT-PCR实验,分析ADHFE1在胃癌中mRNA表达情况;GEPIA、Oncomine数据库中对ADHFE1的表达数据集进行挖掘分析,分析其在不同肿瘤之间的表达差别,并分析胃癌中是否存在差异表达;TCGA数据库下载甲基化数据分析胃癌中ADHFE1甲基化水平与正常组织间有无差别;STRING数据库分析ADHFE1相互作用蛋白;Linkedomics数据库分析ADHFE1相互作用基因并做GO富集分析和KEGG通路分析。结果:经染色结果分析显示,ADHFE1主要在细胞质中表达,大部分呈现黄褐色。在32例癌旁组织中ADHFE1蛋白阳性率为59.4%,超过32例胃癌组织的阳性率34.4%。ADHFE1蛋白的表达与肿瘤浸润深度(P=0.026<0.05)及淋巴结转移(P=0.028<0.05)相关。QRT-PCR显示胃癌组织中ADHFE1mRNA的表达量为1.024±0.226,配对的癌旁组织为2.251±0.450,表达存在统计学差异(P<0.05)。多种数据库显示胃癌中ADHFE1表达水平低于正常组织;分析TCGA数据库得到胃癌中ADHFE1的甲基化水平相较于正常组织升高;富集分析显示,ADHFE1主要存在于细胞质中,有着催化活性、细胞因子结合等分子功能,参与磷脂酶C-激活G蛋白偶联受体的信号传导途径、线粒体基因表达以及调节细胞周期在内的多种生物学进程。结论:ADHFE1在胃癌中表达降低,甲基化水平升高,且ADHFE1的表达水平与胃癌浸润程度和淋巴结转移具有相关性。ADHFE1可能作为一个新的生物标志物用于胃癌的诊断及治疗。

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导师 侯明星
学位信息:
内蒙古医科大学 临床医学 外科学(硕士) 2022年
分类号 R735.2
发布时间 2022-11-14
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