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SARS-CoV2-NSP2与SmgGDS的互作机制和功能研究

摘要新型冠状病毒(SARS-CoV2)是一种于2019年下半年爆发并引起全球大流行的烈性传染性病毒。临床研究发现,感染该病毒后轻症患者出现类似流感的症状,如肌肉乏力、咳嗽、发热等;而在有基础疾病的老龄患者中则易出现呼吸困难、低血氧症、多器官衰竭等严重症状。截至目前,WHO数据显示全球新型冠状病毒肺炎确诊病例累计超过1亿例,其中死亡病例累计突破280万例。遗憾的是,从病毒爆发至今全球的医疗和科研攻坚力量仍未发现能应用于临床的有效药物来遏止新型冠状病毒对患者的侵害。但是随着一些疫苗的成功开发和应用,SARS-CoV2在人群中的感染效率明显下降,新冠大流行也得到了良好的控制。然而,SARS-CoV2具有易突变的狡猾特点,突变毒株会弱化抗体的免疫效果且传染性更强,再次危害全人类的生命安全。因此,了解SARS-CoV2的生物学特点和病毒关键蛋白功能显得尤为重要。<br>  SARS-CoV2与重症急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸系统综合症冠状病毒(MERS-CoV)同属冠状病毒科冠状病毒属,冠状病毒基因组全长有近三万个碱基对(30kb),其在5’端有两个开放阅读框(open-reading frame,ORF1a/ORF1ab),编码16种非结构蛋白(non-structural proteins,NSP1-NSP16)。NSPs不仅在病毒复制过程中形成转录/复制复合物(Replication and Transcription Complex,RTC),还会通过与宿主细胞中的蛋白相互作用,来利用或劫持宿主细胞的部分细胞通路。NSPs在冠状病毒当中高度保守,NSP2作为十六种非结构蛋白保守度较低的一种,其序列相似性只有82.9%。早期研究发现,在SARS-CoV中,NSP2作为NSP3的调节因子存在,NSP2的缺失会影响病毒的生长和病毒RNA的合成,但NSP2其他的生物学功能尚不清楚,在SARS-CoV2中,NSP2是否有相同的功能也尚不清楚。<br>  亲和纯化质谱检测发现,SARS-CoV2-NSP2与小G蛋白二磷酸鸟苷解离促进剂(small G-protein GDP dissociation stimulator,SmgGDS)可能有相互作用。根据文献报道,SmgGDS是一种鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF),能特异性促进RhoA与RhoC(Rho家族鸟苷三磷酸酶A/C)的非活性形式(RhoA-GDP)向活性形式(RhoA-GTP)的转变。RhoA作为在细胞正常生命活动中关键的开关蛋白,在细胞肌动蛋白骨架(actin stress fiber)的重组,细胞运动和附着能力中起着重要作用。<br>  根据以上报道,我们提出以下几个科学问题:SARS-CoV2的NSP2蛋白与SmgGDS是否存在相互作用?这种相互作用在SARS-CoV2和SARS-CoV是否具有保守性?NSP2结合SmgGDS后对其GEF酶活性会有什么影响?在细胞中又会有什么样的表型?<br>  首先我们通过pulldown实验发现,SARS-CoV2-NSP2可以特异性结合SmgGDS,而SARS-CoV-NSP2不能与SmgGDS特异性结合。SARS-CoV2-NSP2与SARS-CoV-NSP2序列对比发现两者氨基酸差异主要集中在蛋白碳端,其次我们通过设计大量SARS-CoV2-NSP2的截短体,发现SARS-CoV2-NSP2与SmgGDS特异性结合位置确实位于SARS-CoV2-NSP2碳端区域,即第506位氨基酸至第638位氨基酸(506-C);我们通过鸟嘌呤核苷酸交换实验,发现SARS-CoV2-NSP2与SmgGDS的互作降低SmgGDS的GEF活性,干扰RhoA上核苷酸的解离;同时我们通过RhoA活化检测实验,发现在HEK293T细胞中SARS-CoV-NSP2会影响RhoA的活化,即RhoA-GTP的生成。以上研究结果,为我们进一步理解SARS-CoV2-NSP2在病毒复制和繁殖过程中的作用和被其感染引发的新型冠状病毒肺炎的发病机制提供了关键的分子基础。

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导师 贾大
学位信息:
分类号 R373
发布时间 2023-03-29
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