摘要甲基转移酶是生物有机体内普遍存在的一种重要酶类,它能催化遗传物质的甲基化,在基因表达及动物生长、发育中起着重要的调控作用。为了更深入地了解甲基转移酶,本文选择卤化物甲基转移酶(HalideMethyltransferase,HMT)作为研究对象。在HMT的催化下,卤化物阴离子接受S-腺苷甲硫氨酸(AdoMet)上的甲基,生成单卤代甲烷(氯甲烷、溴甲烷和碘甲烷)和S-腺苷高半胱氨酸(AdoHcy)。HMT存在于陆地和海洋植物中,这些生物每年都向大气中释放大量一卤甲烷,破坏保护地球的臭氧层。近年来,科学家对HMT开展了广泛深入的研究,但是,大部分研究基于产物成分分析,HMT的基本反应参数及反应机理等都不清楚。因此,本文进一步探讨了HMT的催化机制和蛋白质动力学结构。<br> 由于该反应的一个产物为气体或易挥发液体,很难进行连续捕捉,这为测量动力学参数增加了困难。且AdoHcy与AdoMet的紫外吸收十分相近,通过色谱分离会造成很大误差。在这里,我们将酶偶联法与比色法相结合,动态测定HMT催化不同底物时的动力学参数。整个反应可以通过实时监测5-硫代-2-硝基苯甲酸(TNB)来量化。此方法可以定量出GC-MS无法定量的SCN-催化常数。为了进一步阐明HMT的催化机理,我们测量了反应的动力学同位素效应(KIE)。拟合得到的Cl-、Br-、I-、SCN-的动力学同位素值分别为0.9823±0.0010、0.9845±0.0019、0.9840±0.0014、0.9864±0.0005。这说明与同位素相连的化学键在反应过程中并未断裂,而是杂化方式由sp2转变为sp3,且在反应过渡态中,卤素离子与底物结合的并不紧密。<br> 迄今为止,HMT的晶体结构已经被报道,但是它与底物结合时的动态构象变化尚不清楚。我们通过时间分辨荧光光谱和氢氘交换质谱(HDX-MS)对HMT的结构进行解析。通过时间分辨荧光光谱我们发现,在添加底物(Cl-和I-)后,蛋白质的构象变得比仅有HMT时更刚性。通过氢氘交换质谱(HDX-MS),我们发现残基99-116具有最高的氘吸收率和最高的灵活性,表明它可能是底物结合的位点。然而,158-167位残基的氘吸收率低于0.5%,这可能是因为该残基完全包裹在中心,不随蛋白质构象而变化。该研究有助于了解HMT的催化机制和动态结构,从而更全面的了解甲基转移酶的高效催化和构象变化。
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