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靶向NF-κBp65mRNA的反义寡核苷酸治疗早期牙髓炎

摘要研究目的:<br>  我课题组自行设计出靶向NF-κBp65mRNA的反义寡核苷酸,在体外牙髓炎模型筛选后,在大鼠早期牙髓炎模型观察其对NF-κB表达的影响以及对早期牙髓炎的治疗作用,为临床抑制炎症、保存活髓提供了新的思路。<br>  研究方法:<br>  1.靶向NF-κBp65mRNA反义寡核苷酸的设计:首先,我们利用美国国家生物技术信息中心(NationalCenterofBiotechnologyInformation,NCBI)数据库,分别获得人和大鼠的NF-κBp65mRNA序列。接着,利用NCBI的基础局部排序检索工具(BasicLocalAlignmentSearchTool,BLAST)对比分析,筛选出长度≥25bp的同源序列作为靶区域。在primer软件中,获得了与靶区域互补的候选反义寡核苷酸(Antisenseoligonucleotides,ASOs)。然后,利用Sfold和RNAfoldwebserver在线分析软件评估了所有候选ASOs与靶区域结合的可能性。最后,利用NucleotideBLAST网络数据库对评选出的靶向人和大鼠NF-κBp65mRNA同源序列的ASOs(antisenseoligonucleotidestargetingNF-κBp65mRNA,PMOs)进行了特异性分析。<br>  2.PMOs的体外筛选:我们利用酶消化法和组织块法提取了人牙髓细胞(humandentalpulpcells,hDPCs)和大鼠牙髓细胞(ratdentalpulpcells,rDPCs),通过光学显微镜观察和免疫荧光实验完成DPCs的鉴定。接着,将带有Cy3+荧光标记的PMOs与DPCs共培养,使用激光共聚焦显微镜观察PMOs与DPCs的位置关系。然后,用1μg/ml的脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)分别刺激人牙髓细胞(hDPCs)和大鼠牙髓细胞(rDPCs),通过RT-qPCR法确定抑制NF-κB表达的最佳时间点,建立牙髓炎的细胞模型。将实验组分为对照组、LPS组、LPS+PMO1组、LPS+PMO2组、LPS+PMO3组,利用RT-qPCR法和WB法检测PMO1、PMO2和PMO3对NF-κB基因表达的影响。筛选出效果最佳的PMO进行下一步体内研究。<br>  3.PMO3对早期牙髓炎的治疗作用:将8周龄,体重220g±20g的Wistar雄性大鼠18只,随机分为3个实验组,每组6只。对照组:大鼠不做处理。LPS组:大鼠上颌左右第一磨牙??面中央开髓,将吸附5μlLPS(10μg/ml)的明胶海绵置于开髓孔处,玻璃离子暂封窝洞。LPS+PMO3组:在大鼠上颌左右第一磨牙??面中央开髓,将吸附5μlLPS(10μg/ml)+PMO3(10μg/ml)的明胶海绵置于开髓孔处,玻璃离子暂封窝洞。24h后处死大鼠取材。HE染色观察大鼠牙髓组织病理形态表现:牙髓组织炎症范围和浸润炎症细胞的数量。IHC染色和WB法检测大鼠牙髓组织中NF-κBp65、p-p65以及下游炎症因子IL-1β和TNF-α蛋白表达水平。RT-qPCR法检测各组牙髓组织中NF-κBp65及其下游炎症因子IL-1β和TNF-αmRNA表达水平。将大鼠的心、肝、脾、肺、肾等重要脏器进行HE染色观察:分析PMO3是否有药物毒性作用。<br>  研究结果:<br>  1.利用NCBI网络数据库,获得人和大鼠的NF-κBp65mRNA序列,编号分别为NM_001145138.2和NM_199267.2。然后,利用BLAST网站筛选出人和大鼠NF-κBp65mRNA同源序列中长度≥25bp的12段保守序列。在primer软件中,针对上述12段保守序列设计出了138个与靶区域互补的候选ASOs。接着,利用Sfold和RNAfoldwebserver在线分析软件评估了所有候选ASOs与靶区域结合的可能性,筛选出第29、30、72号候选ASOs。最后,经NucleotideBLAST网络数据库对比分析,所评选出的三个候选ASOs均具有特异性,分别将其命名为PMO1、PMO2和PMO3进行后续实验。<br>  2.光学显微镜观察显示:hDPCs和rDPCs均成梭形或者扁星形,但rDPCs较hDPCs短小。两种细胞生长均有一定方向,覆盖瓶底后呈栅栏状排列,无多层生长,存在接触抑制现象。免疫荧光染色显示:细胞波形蛋白表达阳性,角蛋白表达阴性。RT-qPCR结果显示:在hDPCs中,LPS(1μg/ml)刺激10h时细胞中NF-κBp65mRNA表达量最高;在rDPCs中,LPS(1μg/ml)刺激8h时细胞中NF-κBp65mRNA表达量最高。免疫荧光实验显示:PMO1、PMO2、PMO3均能进入hDPCs和rDPCs内部。RT-qPCR结果表明:与对照组相比,在LPS组中NF-κBp65、IL-1β和TNF-α的mRNA表达均升高。然而,LPS+PMO组中NF-κBp65的mRNA表达水平均降低,下游炎症因子IL-1β和TNF-α的mRNA表达水平降低更为明显。WB实验结果表明:与对照组相比,LPS组中NF-κBp65、p-p65、IL-1β和TNF-α的蛋白表达均升高。然而,LPS+PMO组中NF-κBp65、p-p65的蛋白表达水平均降低,下游炎症因子IL-1β和TNF-α的蛋白表达水平也明显降低。三个PMOs中以PMO3的体外抗炎效果最佳,进一步用于体内牙髓炎模型的研究。<br>  3.大鼠牙髓组织HE染色结果显示:与对照组相比,LPS组牙髓炎症集中在冠髓,有大量的炎症细胞的浸润。与LPS组相比,LPS+PMO3组炎症范围缩小,炎症细胞的浸润减少。体内IHC染色和WB实验结果显示:与对照组相比,LPS组牙髓组织中的NF-κBp65、p-p65的蛋白表达水平均升高,其下游的炎症因子IL-1β和TNF-α的蛋白表达水平升高更明显。而与LPS组相比,LPS+PMO3组牙髓组织中的NF-κBp65、p-p65的蛋白表达水平均降低,其下游的炎症因子IL-1β和TNF-α的蛋白表达水平降低更明显。大鼠牙髓组织RT-qPCR结果显示:与对照组相比,LPS组牙髓组织中的NF-κBp65的mRNA表达水平升高,其下游的炎症因子IL-1β和TNF-α的mRNA表达水平升高更明显。而与LPS组相比,LPS+PMO3组牙髓组织中的NF-κBp65的mRNA表达水平降低,其下游的炎症因子IL-1β和TNF-α的mRNA表达水平降低更明显。大鼠重要脏器的HE染色结果显示:与对照组比较,LPS+PMO3组大鼠各脏器的细胞形态无异常。<br>  研究结论:<br>  1.完成了靶向NF-κBp65mRNA反义寡核苷酸的设计与合成。<br>  2.成功建立了牙髓炎细胞模型和动物模型。<br>  3.PMOs均能进入牙髓细胞内,并成功抑制牙髓炎模型中NF-κBp65及其下游炎症因子的表达。<br>  4.PMO3能治疗LPS引起的牙髓炎症,且具有生物安全性。

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导师 张志民
分类号 R781.31R988.2
发布时间 2023-08-29(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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