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新型冠状病毒非结构蛋白Nsp10和Nsp16基因克隆表达载体的构建及作用底物的制备

摘要目的:<br>  新型冠状病毒(Severeacuterespiratorysyndromecoronavirus2,SARS-CoV-2)隶属于冠状病毒,是一种有具有包膜包裹的正义单链RNA病毒,可引起新型冠状病毒肺炎(CoronaVirusDisease2019,COVID-19)。本研究通过对SARS-CoV-2非结构蛋白Nsp10和Nsp16的基因序列进行克隆,通过原核表达载体系统对两种蛋白进行表达,并成功制备了Nsp10和Nsp16和Nsp10/Nsp16融合蛋白,并通过体外转录的方法对RNA进行加帽,获得Nsp10和Nsp16功能检测所用的底物。<br>  方法:<br>  (1)根据Genebank公布的SARS-CoV-2冠状病毒非结构蛋白Nsp10(NCBI:YP_009725306.1)和Nsp16(NCBI:YP_009725311.1)的基因序列设计引物,用PCR的方法把Nsp10和Nsp16基因从SARS-CoV-2冠状病毒的cDNA片段中扩增出来,将目标基因融合His基因标签后利用限制性内切酶双酶切的方法连接到原核表达载体PET15b和PET30a中,构建重组质粒。重组质粒经PCR和酶切反应进行初步鉴定,并将初步鉴定后的质粒进行测序。如果克隆的Nsp10和Nsp16基因序列与发表基因完全一致,说明成功构建了原核表达载体。<br>  (2)重组质粒PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16的优化诱导表达。将成功构建的原核表达重组质粒PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16转化到大肠杆菌感受态细胞BL21(DE3)中,经菌液PCR鉴定后,通过对时间、IPTG浓度诱导优化后进行蛋白表达。<br>  (3)利用SDS-PAGE电泳和蛋白免疫印迹法(WesternBlot,Wb)验证目的蛋白是否在成功表达。通过SDS-PAGE电泳和Wb验证Nsp10和Nsp16蛋白质是否以可溶形式存在,为得到纯度较高的Nsp10和Nsp16蛋白质,对非结构蛋白Nsp10和Nsp16的表达和纯化条件进行了优化,利用镍层析柱对非结构蛋白Nsp10、Nsp16和Nsp10/Nsp16融合蛋白进行纯化。<br>  (4)对RNA加帽底物进行制备。通过KOD酶对SARS-CoV-2冠状病毒进行UTR的cDNA片段的克隆,利用体外转录试剂盒进行体外转录获得RNA,通过CappedRNASynthesis加帽系统对RNA进行加帽,以得到RNA加帽底物。<br>  结果:<br>  (1)将SARS-CoV-2冠状病毒非结构蛋白Nsp10的复制子和PET15b质粒通过限制性内切酶BamHI和XhoI进行酶切连接构建,命名重组质粒为PET15b-Nsp10。将SARS-CoV-2冠状病毒非结构蛋白Nsp16的复制子和PET30a质粒通过限制性内切酶NdeI和XhoI进行酶切连接构建,命名重组质粒为PET30a-Nsp16。测序结果显示成功构建了PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16重组质粒。<br>  (2)将重组质粒PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16通过蓝白筛选后将克隆正确测序的PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16表达质粒转化到大肠杆菌中,种在带有抗性的LB培养板上,37℃下培养12-14小时后,挑取单克隆菌株通过优化培养条件,选择0.1mMIPTG培养16h将PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16重组质粒进行大量目的蛋白的表达。<br>  (3)通过SDS-PAGE电泳和Wb发现Nsp10和Nsp16蛋白质大量表达并以可溶形式存在,对非结构蛋白Nsp10和Nsp16进行了优化纯化条件并通过镍层析柱进行纯化,获得了纯化后的Nsp10和Nsp16蛋白质,并将菌体混合进行Nsp10/Nsp16融合蛋白的纯化。<br>  (4)通过体外转录的方法到了SARS-CoV-2冠状病毒的UTR的RNA,通过CappedRNASynthesis加帽系统对RNA进行加帽,以得到RNA作用底物。<br>  结论:<br>  (1)成功构建了SARS-CoV-2冠状病毒Nsp10和Nsp16表达载体PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16。<br>  (2)成功表达了PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16重组质粒,成功优化培养条件并大量表达以可溶形式存在的Nsp10和Nsp16蛋白。<br>  (3)成功通过镍层析柱纯化了Nsp10和Nsp16蛋白和Nsp10/Nsp16融合蛋白,为体外功能的研究提供了基础。<br>  (4)成功通过体外转录的方法得到了底物RNA进行加帽,为甲基化功能检测提供了底物。

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