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IBV非编码RNA对TIRAP-TRAF6-JNK/NF-κB信号通路的调控作用

摘要传染性支气管炎病毒(Infectiousbronchitisvirus,IBV)是一种具囊膜的单股正链RNA病毒,属于冠状病毒科γ冠状病毒属。IBV感染细胞后,采取不连续转录机制,产生6条病毒mRNA,包括全长基因组RNA1和5条亚基因组RNA(sgRNA2-6)。前期研究结果表明,IBV-Beaudette可利用不连续转录机制产生一条非编码RNA(ncRNA),该ncRNA全长563核苷酸(nt)(不包括poly(A)尾),由IBV基因组3''-非翻译区(UTR)和长63nt的基因组5''端前导序列组成,利用反向遗传学技术获得了不形成ncRNA的病毒突变体rIBV-C27107G,发现其在Vero细胞的复制和致病性与rIBV无显著性差异,但转录组测序分析发现IBV-ncRNA可调控H1299细胞Toll-likereceptorsignalingpathway,Jak/Statsignalingpathway等信号通路上与抗病毒反应相关基因的表达。许多病毒可通过不同的机制形成ncRNA,在病毒生命周期中发挥重要作用,但IBV-ncRNA的生物学功能尚知之甚少。因此,本研究选择rIBV和rIBV-C27107G感染H1299细胞中差异表达较大的基因,采用荧光定量RT-PCR和Westernblot技术,检测相关基因在两种病毒感染细胞中的表达水平,分析该ncRNA对细胞相关因子的调控作用。主要研究结果如下:<br>  (1)IBV-ncRNA抑制rIBV-C27107G引起的HSPA4上调表达,但增强了XRCC5的表达。在rIBV感染16小时的H1299细胞中HSPA9、HSPA4、HSP90B1、XRCC5、PPIA和UCHL1的表达量分别是MOCK组细胞中的1.12、0.17、0.97、1.94、1.83和1.62倍,而在rIBV-C27107G感染16小时的H1299细胞中它们各自的表达量分别是MOCK组细胞中的1.30、1.27、1.41、0.97、1.04和2.31倍。分析可得,rIBV-C27107G感染H1299细胞中的HSPA9、HSPA4、HSP90B1、XRCC5、PPIA和UCHL1的表达量分别是rIBV感染的细胞中的1.16、7.47、1.45、0.50、0.57和1.43倍。<br>  (2)IBV-ncRNA可抑制由HSPA4调控的TIRAP-TRAF6-NF-κB信号通路中相关基因的表达。在rIBV感染12小时的H1299细胞中,HSPA4、TIRAP、TRAF6、NF-κB、ICAM-1和MCP-1的表达量分别是MOCK组细胞的0.44、0.59、0.41、0.62、0.47和0.53倍,而在rIBV-C27107G感染12小时的H1299细胞中这些基因的表达量分别是MOCK组细胞中的1.23、1.74、1.02、1.77、1.40和2.64倍。比较分析显示,rIBV-C27107G感染H129912小时后,细胞中HSPA4、TIRAP、TRAF6、NF-κB、ICAM-1和MCP-1的表达量分别为rIBV感染细胞中的3.24、2.95、2.49、2.85、2.98和4.98倍。<br>  (3)IBV-ncRNA抑制了JNK的磷酸化。两种病毒感染后,在20-28小时内,JNK的磷酸化水平逐渐升高,rIBV-C27107G感染细胞中p-JNK/JNK比值分别为0.16、0.34和0.58,但在相同时间点,rIBV-C27107G感染细胞内JNK的磷酸化水平均高于rIBV感染,rIBV感染H1299细胞p-JNK/JNK比值分别为0.25、0.38、0.96。分析可知,在两种病毒感染28小时p-JNK/JNK蛋白的表达量差异最大,rIBV-C27107G感染细胞的p-JNK/JNK蛋白的表达量是rIBV感染细胞中1.66倍;<br>  (4)IBV-ncRNA增加CyclinD1的表达量。两种病毒感染后,在12-28小时内,CyclinD1的表达量逐渐下降,但在相同时间点,rIBV感染细胞CyclinD1的表达量均高于rIBV-C27107G感染。rIBV感染H1299细胞12-28小时内不同时间点CyclinD1表达量比值分别是1.88、1.75、0.59、0.06和0.10,rIBV-C27107G感染细胞12-28小时内不同时间点CyclinD1表达量比值分别是1.85、1.19、0.19、0.03和0.06。分析可得,在两种病毒感染20小时CyclinD1的量差异最大,rIBV感染细胞的CyclinD1表达量是rIBV-C27107G感染细胞中3.11倍;<br>  (5)IBV-ncRNA抑制c-Fos的表达。c-Fos蛋白的表达量在病毒感染16-24小时内逐渐升高,在感染24小时以后,c-Fos蛋白的表达量下降。在两种病毒感染16小时c-Fos蛋白的表达量差异最大,rIBV-C27107G感染细胞的c-Fos蛋白是rIBV感染细胞中2.47倍;<br>  (6)IBV-ncRNA对SOCS3表达和eIF2α磷酸化无显著影响。SOCS3蛋白的表达量在两种病毒感染8-16小时内逐渐升高,在感染16小时后达到顶峰,在病毒感染20-28小时后SOCS3表达量变化不大,且在相同时间点,rIBV-C27107G感染细胞内SOCS3的表达量与rIBV感染没有显著差异;eIF2α的磷酸化水平随病毒感染时间延长逐渐升高,但两种病毒感染的细胞中p-eIF2α/eIF2α表达量比值无显著差异。<br>  基于这些研究结果,我们推测IBV-ncRNA能抑制TIRAP-TRAF6-NF-κB通路的激活,引起下游基因ICAM-1、MCP-1等的表达减少,同时在一定程度上抑制细胞TIRAP-TRAF6-JNK通路中JNK的磷酸化,导致下游cFos蛋白的表达减少,二者可能进一步影响细胞存活和病毒复制;另外,IBV-ncRNA会诱导细胞周期蛋白D1表达增加,同时上调XRCC5的表达,可能会使停滞于G1期细胞增多,影响细胞周期。

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导师 方守国
学位信息:
长江大学 其他 资源利用与植物保护(硕士) 2023年
分类号 R373.1
发布时间 2023-11-01
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