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摘要肾癌是一种常见的恶性肿瘤，其中肾透明细胞癌约占75%，是最常见的肾癌类型。肾透明细胞癌存活率较低并且目前缺少有力的免疫检查点和靶向治疗抑制剂。可变剪切(Alternative splicing, AS)是癌症新的生物标志物和治疗靶点，本文在肾癌中结合转录因子(Transcription factor, TF)和RNA结合蛋白(RNA-binding protein, RBP)来研究三者的调控网络，以此来探索可变剪切的调控机制以及为肾癌患者发现有效的生物标志物或治疗靶标。<br>　　本文首先基于统计方法进行特征选择，主要分为两步。第一步是采用互信息-迭代确定独立筛选-LASSO(Mutual information-Iterative sure independence screening-LASSO, MI-ISIS-LASSO)的组合算法，从肾癌大量的可变剪切事件(AS events, ASEs)中筛选出肾癌特异表达的ASEs；第二步是结合Wilcoxon秩和检验和Log2FoldChange(Log2FC)来对RNA结合蛋白和转录因子进行差异分析，选出肾癌特异性表达的RNA结合蛋白和转录因子。然后，为了发现具有潜在调控关系的转录因子、RNA结合蛋白和可变剪切，构建了线性混合效应模型来识别TF-RBP-AS三联体；并根据转录因子丰度以及RNA结合蛋白表达量和其靶向ASE的PSI水平的相关性变化来判别三联体功能。最后，是对三联体相互作用的验证以及其应用研究，检验三联体之间的调控关系，以及验证三联体的预后价值。结果表明：转录因子、RNA结合蛋白和可变剪切之间的调控网络很复杂，并且三联体网络在一定程度上揭示了RNA结合蛋白和转录因子在可变剪切机制失调过程中的作用关系；TF-RBP-AS三联体在肾癌中起着关键的作用，并且相比于单一的转录因子、RNA结合蛋白和可变剪切，三联体具有更好的预后价值，有望成为新的肾癌生物标志物或治疗靶标。<br>　　本文的创新主要有以下两点：（1）构建了线性混合效应模型来研究肾癌中转录因子、RNA结合蛋白和可变剪切的调控网络；（2）将转录因子和RNA结合蛋白引入到肾癌的可变剪切研究中，为可变剪切的研究提供了一个新的视角；并且三联体具有作为肾癌生物标志物或治疗靶标的潜质，为肾癌的治疗做了一点帮助。