摘要背景与目的:肝细胞癌(以下简称肝癌)是目前严重威胁人类健康的恶性肿瘤之一,手术切除、肝动脉化疗栓塞术(TACE)、射频消融等是目前针对肝癌的主要治疗方法。肝癌在我国发病率高,超过60%的患者在确诊肝癌时,已进入了中晚期,失去了最佳治疗时机,进而导致肝癌患者的治疗效果差、高死亡率、高复发率等特点,即便放疗、化疗手段被采取,治疗效果依然有限。近些年来,肿瘤免疫治疗成为了一种新型治疗手段,一跃成为了恶性肿瘤基础研究和临床研究的热门,以PD-1抑制剂为首的免疫检查点抑制剂可以解除免疫抑制,恢复T细胞活性,从而杀伤肿瘤细胞,达到治疗目的。然而,很多肝癌患者并未从免疫治疗中获益,反而出现免疫相关不良事件等并发症,因此,深入挖掘影响肝癌免疫微环境的潜在机制分子尤为重要。BTN3A家族,也被称为CD277,是嗜乳脂蛋白的一个亚家族,包括BTN3A1,BTN3A2和BTN3A3。BTN3A家族可以调节抗原特异性αβ-T细胞反应,在调节γδ-T细胞功能中也起着关键作用,抗BTN3A1的抗体可以将BTN3A1从免疫抑制剂转化为免疫刺激分子,从而动态激发通过协调αβ和γδ-T细胞驱动的抗肿瘤免疫,从而阻止卵巢癌的进展,而BTN3A1在肝癌中的作用并未研究阐述。生物信息学挖掘技术是通过分析公共数据库中的高通量测序数据及对应的临床信息,挖掘潜在的肿瘤标志物,并预测其潜在的生物学功能的一种热门的研究方法。本研究通过生物信息学挖掘技术,探究BTN3A1在肝癌中的表达及其与肝癌免疫浸润的相关性,希望获得潜在治疗靶点,为肝癌的治疗研究提供新方向。<br> 方法:通过TIMER(TumorImmuneEstimationResource)数据库分析BTN3A1在泛癌中的表达水平,再通过UCSC(UniversityofCaliforniaSantaCruz)数据库中下载了经统一标准化的泛癌数据集:TCGATARGETGTEx(PANCAN,N=19131,G=60499),再次验证了BTN3A1基因在各个样本中的表达数据。随后,利用R语言,针对泛癌数据集,分析BTN3A1与免疫细胞的相关性。随后,通过对肝癌患者的组织进行定量实时聚合酶链反应(Quantitativerealtimepolymerasechainreaction,qRT-PCR)及蛋白质免疫印迹分析(Westernblot,WB),进一步验证BTN3A1在肝癌组织及癌旁组织中mRNA水平和蛋白质水平的表达差异。BTN3A1的潜在生物学功能和信号通路使用GO、KEGG、GSEA富集分析实现。TIMER(TumorImmuneEstimationResource)数据库被用来分析BTN3A1与肝癌中免疫细胞浸润、免疫微环境和免疫细胞分子标志物之间的相关性。<br> 结果:BTN3A1在不同肿瘤中表达情况不同,其中,在肾细胞癌、肝细胞癌、胆管细胞癌、食管癌等肿瘤中显著上调,在乳腺浸润癌、肾嫌色细胞癌、子宫内膜癌、肺腺癌、肺鳞癌、前列腺癌等肿瘤中显著下调。利用R语言对TCGATARGETGTEx数据集分析,发现BTN3A1在多种肿瘤中,与免疫细胞浸润密切相关。在蛋白表达水平及mRNA水平,BTN3A1在肝癌患者的癌组织中的表达均明显高于癌旁正常组织。GO、KEGG、GSEA富集分析发现BTN3A1与可能与包括B细胞受体信号通路、T细胞受体信号通路、抗原加工提成信号通路等多种免疫相关的信号通路密切相关。在TIMER数据库中免疫细胞浸润分析显示,肝癌中BTN3A1的表达与B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、NK细胞的浸润程度有关(P<0.05)。<br> 结论:<br> (1)BTN3A1在多种肿瘤中表达失调,且在多种肿瘤中与免疫细胞浸润显著相关,这说明BTN3A1可能在肿瘤免疫微环境中起到了重要作用。<br> (2)通过数据挖掘及单中心临床样本验证,发现BTN3A1在肝细胞癌组织中高表达。<br> (3)BTN3A1与多种免疫相关的信号通路关系密切,且与肝癌组织中的多种免疫细胞浸润具有显著相关性,其基因表达可能通过影响肿瘤免疫微环境调控肝细胞癌的进展。
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