摘要背景和目的:肺癌是人类恶性肿瘤中最常见一种肿瘤,依然是全世界癌症相关死亡的主要原因。根据最近流行病学调查结果显示,肺癌发病人数逐年升高,其病死率和发病率仅次于乳腺癌。肿瘤的早期发现和分期对肺癌的治疗非常重要。80%~85%的肺癌是非小细胞型肺癌,肺腺癌是主要亚型,其治疗方式主要根据TNM(Tumor,LymphNode,Metastasis)期系统确定,尽管目前手术治疗、放化疗、免疫治疗以及靶向治疗的发展不断进步,对于肺癌的生存率有了很大的提高,但仍有85%的患者最终死于癌症复发或者转移。近年来免疫检查点抑制剂(immunecheckpointinhibitors,ICIs)在临床中不断实践,肺癌的免疫治疗也改变了肺癌的治疗现状。因此,迫切需要探索和开发新的生物标志物用于肺腺癌的诊治。KNL1(动粒支架1)是组成动粒的重要蛋白质,动粒是多亚基蛋白组装体,它的功能是将染色体连接到纺锤体微管来促进染色体分离,KNL1被看作有丝分裂过程中动粒形成和分离染色体的基础,参与多种肿瘤的增殖、凋亡等过程。KNL1与肺腺癌的研究以及KNL1的免疫浸润方面的研究尚未有报道。在本研究中,我们利用生物信息学技术联合免疫组织化学分析了KNL1在肺腺癌中的表达以及临床意义。<br> 方法:应用多种生物信息学方法联合构建组织芯片技术。首先,我们进行了TCGA数据库挖掘,使用R语言进行分析和绘制,在TCGA数据库中分析KNL1在不同肿瘤类型中的表达情况,讨论KNL1的表达与肺腺癌临床特征的关联,利用逻辑回归分析评估KNL1的表达对肺腺癌患者总体生存时间的影响。然后,我们利用免疫组化实验验证了KNL1在肺腺癌中的过表达以及对肺腺癌预后的影响。其次,我们还研究了KNL1与肺腺癌免疫细胞以及免疫功能的关系。此外,我们筛选的差异基因利用GO和KEGG富集分析,研究了KNL1及其差异基因潜在的生物学功能。最后我们还对KNL1表达水平和体细胞突变的关系做了研究。<br> 结果:生物信息学分析结果显示,KNL1在肺腺癌组织中高表达(P<0.001),并且KNL1的表达与肺腺癌患者的性别、吸烟史、病理T分期、FPI、OS、DSS显著相关(所有P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析显示KNL1高表达预示着肺腺癌患者较差的预后(P<0.01),KNL1是肺腺癌患者预后不良的独立危险因素(P=0.003)。免疫组化实验显示KNL1在肺腺癌组织中的表达明显高于癌旁组织(P<0.01),这也验证了生物信息学的分析。KNL1的表达与具有重要标记基因的活化CD4T细胞、具有效应记忆的CD8T细胞、记忆B细胞等有差异性表达(P<0.05)。KNL1过表达会产生较多的细胞突变组,促进肺腺癌肿瘤细胞的增殖,产生较差的预后。<br> 结论:本研究中KNL1在肺腺癌中高表达,KNL1表达水平是肺腺癌患者预后不良的独立危险因素,我们推测KNL1可作为LUAD诊断及预后的新型标记物。KNL1的表达与免疫浸润、细胞突变有关,我们推测KNL1参与肺腺癌的增殖,为肺腺癌患者的免疫治疗和靶向治疗提供新的参考。
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