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摘要目的： ATM蛋白激酶在代谢、发育和应激反应过程中发挥着重要作用，具有多种功能，p53转录因子参与调节了细胞周期的各个阶段，在 DNA损伤应答中发挥重要的作用。大量的研究发现 ATM 和 p53信号通路间存在相互作用，共同参与 DNA损伤应答。本课题系统分析了 ATM 和 p53调节的基因，包括 mRNA和非编码 RNA，将大大有助于理解 ATM和 p53的功能和调控机制。<br>　　方法：1. 对野生型果蝇w 1118、atm突变果蝇atm stg和p53突变果蝇p53 5A-1-4的三期幼虫使用40 Gy剂量辐照处理，对野生型和p53突变果蝇的胚胎进行4 Gy辐照处理，恢复1小时，进行RNA-seq。未辐照处理的果蝇作为对照。<br>　　2. 使用trim_galore去除接头，使用FastQC去除低质量数据后，使用STAR比对到参考基因组中，通过DESeq2鉴定差异表达的蛋白质编码基因、lncRNA和miRNA。当 |log2-fold change| ≥ 1和padj.＜0.05时该基因被认定为差异表达基因。<br>　　3. 使用DAVID数据库对差异表达的蛋白质编码基因的GO和KEGG功能富集分析。<br>　　4. 辐照处理miRNA敲除或敲低果蝇，检测生存率。<br>　　结果：1. atm突变果蝇中上调表达462个蛋白质编码基因、6个miRNAs和45个lncRNAs；下调表达331个蛋白质编码基因、11个miRNAs和32个lncRNAs。辐照处理后，atm突变果蝇中上调表达129个蛋白质编码基因、5个miRNAs和15个lncRNAs；下调表达61个蛋白质编码基因、2个miRNAs和9个lncRNAs。<br>　　2.atm突变果蝇中差异表达的蛋白质基因的功能富集在代谢过程、免疫应答、DNA损伤应答或氧化应激。<br>　　3. p53突变果蝇胚胎时期上调表达817个蛋白质编码基因和25个lncRNAs；下调表达477个蛋白质编码基因和24个lncRNAs。在三期幼虫时期上调表达134个蛋白质编码基因和26个lncRNAs；下调表达96个蛋白质编码基因和33个lncRNAs。辐照处理后，p53突变果蝇胚胎时期上调表达814个蛋白质编码基因和23个lncRNAs；下调表达564个蛋白质编码基因和23个lncRNAs。在三期幼虫时期上调表达69个蛋白质编码基因和20个lncRNAs；下调表达92个蛋白质编码基因和14个lncRNAs。<br>　　4. p53突变果蝇中差异表达的蛋白质编码基因主要参与 DNA损伤应答、代谢和免疫等功能。<br>　　5. miR-1007敲低果蝇对辐照敏感，miR-963敲低果蝇和miR-274敲除果蝇对辐照不敏感。<br>　　结论：atm突变果蝇中差异表达的蛋白质编码基因和miRNA的功能多样化，与代谢、免疫反应、多细胞生物过程、刺激反应等高度相关，并形成基因功能簇。这些现象在辐照处理后仍然存在。p53突变果蝇中差异表达的蛋白质编码基因与 DNA损伤应答、代谢和免疫等通路高度相关。