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mmu_circ_009056通过miR-139-3p/Pax5调控RUNX2在BMSCs成骨分化中的机制研究

摘要背景:<br>  骨髓间充质干细胞(BoneMarrowMesenchymalStemCells,BMSCs)已广泛用于基因治疗,组织工程,细胞替代治疗和再生医学,被认为是一种非常理想的种子细胞。BMSCs的成骨分化在转录和转录后水平上受一系列编码RNA和非编码RNA的调节。因此,进一步探索BMSCs的成骨分化调控机制有助于BMSCs在骨组织工程中的应用。目前,有关环状RNA在BMSCs成骨分化过程中的作用机制尚不明确。在本课题组前期的研究中已经通过实验验证了mmu_circ_009056通过miR-22-3p靶向调控BMP7从而介导MC3T3细胞系的成骨分化,实验中我们发现,干扰mmu_circ_009056使成骨标志物RUNX2的表达下降,而其作用机制尚不明确。因此,本次研究在前期研究基础上,以成骨标志物RUNX2为研究的目的基因,深入探索mmu_circ_009056在BMSCs成骨诱导分化过程中对RUNX2的调控机制。<br>  目的:<br>  在本实验研究中,通过细胞实验来检测mmu_circ_009056在BMSCs成骨诱导过程中的作用,并进一步探讨mmu_circ_009056在成骨向分化过程中通过介导miR-139-3p/Pax5调控RUNX2的作用机制。<br>  材料和方法:<br>  (1)配制成骨诱导液,体外诱导C57/BL小鼠骨髓间充质干细胞(BMSCs)成骨向分化,茜素红染色检测诱导液效果,qRT-PCR检测成骨相关转录因子RUNX2、OPN,以及mmu_circ_009056的表达。<br>  (2)在功能实验中,设计小分子干扰RNA(siRNA),利用转染技术干扰mmu_circ_009056,通过茜素红染色、qRT-PCR以及Westernblot检测mmu_circ_009056对BMSCs成骨向分化的影响。<br>  (3)对干扰mmu_circ_009056处理3d、7d的BMSCs样本进行miRNA测序以及mRNA测序。筛选出3d、7d共同表达下调的mRNA和共同表达上调的miRNA。通过文献查阅进行mRNA的筛选,通过qRT-PCR验证测序结果。通过RegRNA2.0和miRWalk2.0等网站预测mmu_circ_009056和筛选得到的mRNA可能靶向结合的miRNA,与miRNA测序结果取交集。通过qRT-PCR验证测序结果。RNAhybrid验证及预测结合的作用靶点。UCSC网站检测得到RUNX2启动子区域的序列,结合PROMO网站预测结合RUNX2启动子的转录因子。<br>  (4)细胞转染技术构建miR-139-3p过表达与低表达BMSCs细胞模型,qRT-PCR实验检测miR-139-3pmimic和miR-139-3pinhibitor的干扰效率,并通过qRT-PCR、Westernblot检测Pax5以及RUNX2的表达。<br>  (5)设计针对Pax5的siRNA,将si-Pax5转染进入BMSCs细胞,qRT-PCR实验确定si-Pax5的转染效率,通过qRT-PCR、WesternBlot检测RUNX2的表达水平。<br>  (6)诱导C57/BL小鼠骨髓间充质干细胞(BMSCs)成骨向分化,qRT-PCR检测miR-139-3p及pax5的表达。<br>  结果:<br>  (1)qRT-PCR检测结果显示,BMSCs细胞成骨向诱导3d、7d,mmu_circ_009056的表达水平明显高于对照组。<br>  (2)转染siRNA干扰mmu_circ_009056后可降低mmu_circ_009056的表达。14d茜素红染色实验显示干扰mmu_circ_009056的siRNA组较阴性对照组(NC)的钙结节显著降低,qRT-PCR和Westernblot结果显示RUNX2在mRNA和蛋白水平的表达均降低,说明了mmu_circ_009056在BMSCs成骨分化过程中的起正向调节作用。<br>  (3)对干扰mmu_circ_009056处理3d、7d的BMSCs样本的mRNA测序结果进行筛选,筛选出3d、7d样本有共同下调表达且与成骨相关的基因Pax5、Apod、Mx1、Ccl5。qRT-PCR结果显示,与阴性对照组相比,siRNA组中Pax5下调最显著,结果具有统计学意义,因此将Pax5作为研究对象。通过RegRNA2.0和miRWalk2.0等网站预测mmu_circ_009056和筛选得到的Pax5可能靶向结合的miRNA,与miRNA测序结果取交集得到miR-139-3p、miR-365-1-5p,qRT-PCR结果显示miR-139-3p表达上升更显著,因此将miR-139-3p作为研究对象。根据RNAhybrid可知miR-139-3p与mmu_circ_009056和Pax5均存在互补配对序列。<br>  (4)通过生物信息学网站RNAhybrid预测出miR-139-3p与Pax5的3’UTR存在靶向结合关系。通过转染miR-139-3pinhibitor能够促进Pax5和RUNX2在mRNA和蛋白水平的表达,而转染miR-139-3pmimic能够抑制Pax5和RUNX2在mRNA和蛋白水平的表达。qRT-PCR与WesternBlot实验显示miR-139-3pmimic能够负向调节靶基因Pax5以及RUNX2的表达。<br>  (5)通过PROMO预测网站得出有2个在RUNX2的启动子上游2000bp区域与Pax5结合的位点结合。qRT-PCR与WesternBlot结果显示抑制Pax5表达能够抑制RUNX2在mRNA和蛋白水平的表达。<br>  (6)与完全培养基组(PM)相比,在诱导组(OM)中miR-139-3p的表达下调,同时Pax5及RUNX2在mRNA和蛋白水平的表达上调。<br>  结论:<br>  mmu_circ_009056正向调节BMSCs的成骨分化过程。mmu_circ_009056可能通过对miR-139-3p/Pax5表达的调控,调节RUNX2的表达从而调控BMSCs的成骨诱导反应。

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导师 郭吕华
学位信息:
广州医科大学 口腔医学 口腔医学(硕士) 2020年
分类号 R329.2
发布时间 2024-06-28
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