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血浆游离mtDNA特征变量作为非小细胞肺诊断标志物的应用研究

摘要研究背景与研究目的:<br>  非小细胞肺癌(Non-small-celllungcancer,NSCLC)约占肺癌总数的85%,是目前全球发病率最高的肿瘤类型。然而,传统检测手段面临一定挑战,例如胸部低剂量螺旋CT(Low-doseCT,LDCT)存在假阳性率高和辐射暴露的风险高的问题,传统的血清肿瘤学标志物如癌胚抗原(Carcinoembryonicantigen,CEA)、神经元特异性烯醇化酶(Neuron-specificenolase,NSE)等特异性较低,作为金标准的组织病理学作为有创检查,接受度低。近年来,液体活检可通过非侵入性的手段获取癌症患者体液中的循环肿瘤细胞(Circulatingtumorcells,CTC)、游离DNA(Cell-freeDNA,cfDNA)和外泌体等成分,动态监测肿瘤的发生发展,有望替代传统组织活检,为癌症的筛查、治疗选择、预后评估等方面提供新的诊疗策略。血浆cfDNA由血浆游离核DNA(Circulatingcell-freenuclearDNA,cf-nDNA)和血浆游离线粒体DNA(CellfreemitochondrialDNA,cf-mtDNA)组成。与cf-nDNA相比,cf-mtDNA具有突变率高、拷贝数多、测序过程中具有产生的数据量小、检测快速、成本低的独特优势,因此,cf-mtDNA可能成为一种更有潜力的肿瘤标志物。目前cf-mtDNA单一特征在肿瘤诊断中的应用研究比较多见,但局限于小范围研究,不同文献得到的结果具有差异,显示出一定的不足。故本研究通过对NSCLC与肺良性(Lungbenign,LB)患者血浆cf-mtDNA进行特征图谱分析,开发出NSCLC的诊断预测标志物,并基于此构建多特征联合的NSCLC诊断模型,以期对NSCLC患者的诊断在快速、灵敏、准确等方面发挥积极的作用。<br>  研究方法:<br>  1.通过设置严格的入组标准和排除标准,于2021年6月23日至2022年4月30日期间在空军军医大学第一附属医院和第二附属医院住院的患者中,收集初次影像学或病理学诊断为NSCLC或LB疾病患者的外周抗凝全血样本分别为162例和84例。同时收集入组患者的临床信息、术前血液肿瘤标志物检测结果、基因检测结果、病理学诊断信息及影像学检查结果。<br>  2.提取NSCLC患者与LB疾病患者的血浆cfDNA,构建全基因组文库、进行血浆游离mtDNA靶向捕获及二代测序,分析NSCLC患者及LB疾病患者的cf-mtDNA拷贝数及片段组学特征图谱。<br>  3.对患者的临床信息、传统肿瘤标志物及cf-mtDNA的特征图谱进行单因素方差分析,最后将统计学意义显著的指标纳入Logistic回归模型进行多因素分析,构建NSCLC诊断模型。<br>  4.根据NSCLC预测模型绘制受试者工作特征曲线(Receiveroperatingcharacteristic,ROC),计算曲线下面积(Areaunderthecurve,AUC),利用灵敏度和特异度对模型的诊断效能进行评估。<br>  研究结果:<br>  1.和LB患者相比,NSCLC患者血浆游离mtDNA拷贝数减少,片段偏短、C和CC末端基序占比降低,AAG和AAGC末端碱基基序占比增加。<br>  2.通过单因素方差分析发现传统肿瘤标志物CEA、CYFRA21-1、血浆中cf-mtDNA拷贝数、cf-mtDNA片段占比≤210bp和cf-mtDNA片段占比≤240bp、C、CC、AAG、AAGC末端碱基基序占比均为NSCLC的独立危险因素(P<0.05)。利用Logistic多因素回归确定以上危险因素诊断决策参数权重,其中血浆cf-mtDNA拷贝数、cf-mtDNA片段占比≤210bp、cf-mtDNA片段占比≤240bp、AAG、AAGC末端碱基基序占比被纳入NSCLC诊断预测模型。<br>  3.根据NSCLC预测模型绘制ROC曲线,AUC为0.8290,灵敏度为0.863,特异度为0.679。<br>  结论:<br>  1.血浆cf-mtDNA的拷贝数、片段化程度、末端碱基基序作为一种新型肿瘤标志物在肿瘤检测中具有潜在应用价值。<br>  2.本研究基于多因素逻辑回归建立的NSCLC诊断模型取得了较好的诊断效能。

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导师 权志博
学位信息:
陕西中医药大学 临床医学 临床检验诊断学(硕士) 2023年
分类号 R735.2
发布时间 2024-07-05
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