摘要目的:本研究拟筛选胃癌患者组织中差异表达显著的piRNA,探究其作为新型胃癌标志物的潜在价值。<br> 方法:高通量测序筛选胃癌组织和癌旁组织中差异表达的piRNAs,实时荧光定量聚合酶链式反应进行验证,最终确定piR-hsa-65196作为研究对象,并在胃癌患者和胃良性病变以及健康人血清中进行大批量验证。将胃癌患者的临床分期、TNM肿瘤分级、性别、年龄、淋巴结转移、肿瘤大小等进行分类,分成各种亚组,将各个亚群之间的piR-hsa-65196的表达量进行组间及组内分析。收集胃癌患者的糖类抗原199和癌胚抗原以及糖类抗原724的临床检测数据,使用受试者操作特性曲线比较piR-hsa-65196、CA-199、CEA和CA-724以及piR-hsa-65196分别与CA-199、CEA和CA-724联合诊断效能分析;利用TargetScan、miRanda两款软件和R语言对piR-hsa-65196分别进行靶基因预测,对预测出的的靶基因进行GeneOntology分析和KEGG通路富集分析对其作用的通路和功能进行初步探究。<br> 结果:①高通量测序证实筛选出的piR-hsa-65196在胃癌患者的肿瘤组织和癌旁组织中差异表达(P<0.05)。②qRT-PCR结果显示,piR-hsa-65196在胃癌患者与健康人血清及胃良性病变中差异表达(P<0.001)。③发现piR-hsa-65196在胃癌患者中的表达量与肿瘤分级、是否有淋巴结转移、神经侵犯、血管侵犯、脉管癌栓明显相关;与临床分期、性别、年龄、肿瘤大小、远处转移、组织学分级没有显著相关性。④ROC曲线结果表明,piR-hsa-65196的诊断性能要优于临床常用诊断胃癌的诊断标志物CA-199和CEA,但是略差于肿瘤标志物CA-724。但是将piR-hsa-65196与CA-199、CEA和CA-724分别联合,则AUC分别是:0.8052(95%CI:0.7338~0.8767),0.8091(95%CI:0.7387~0.8795),0.8330(95%CI:0.7672~0.8987),其诊断性能要优于四种肿瘤标志物单独诊断。⑤GO分析显示,在细胞组分中,下调的piRNA的靶基因主要分布在细胞膜、细胞质和细胞核中;在分子功能方面,下调的piRNA的靶基因的功能主要是蛋白质结合、金属离子结合、核苷酸结合;在生物学进程上,下调的piRNA的靶基因主要参与信号转导、RNA聚合酶Ⅱ对转录的调控、DNA模板转录的调控。piR-has-65196靶基因的KEGG数据库分析结果中显示下调的piRNA的靶基因主要富集在ErbB信号通路,癌症通路、癌症中的蛋白聚糖。其有可能通过以上通路调节细胞增殖、迁移、分化、凋亡和细胞运动能力,从而促进肿瘤的发生发展。<br> 结论:1. piR-hsa-65196在胃癌患者血清中的表达明显低于健康成人组和胃良性病变组,其表达量与临床分期、肿瘤分级,是否有淋巴结转移、神经血管侵犯、脉管癌栓明显相关<br> 2.piR-hsa-65196对胃癌的诊断效能明显优于CA-199和CEA,且其与CA-199、CEA和CA-724的联合诊断效能优于单组诊断效能<br> 3. 预测出piRNA下调相关的靶基因,GO和KEGG分析其与ErbB信号通路密切相关,提示piR-hsa-65196可能通过ErbB信号通路抑制肿瘤的发生发展。
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