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基于新型EDC双输出模式级联信号放大灵敏检测microRNA方法研究

摘要MicroRNAs(miRNAs)是一类短链非编码RNA,研究表明miRNA是临床肿瘤实验室诊断潜在的新型生物标志物。精准检测特定miRNA对临床诊断,疾病风险判断等有十分重要的意义。然而,鉴于miRNA的序列长度短,表达水平低,以及序列同源性高等特征,精准检测miRNA面临着巨大的挑战。因此,迫切需要研究出一种灵敏特异的miRNA检测新方法。<br>  熵驱动催化(Entropy-driven catalysis,EDC)作为一种无酶等温扩增技术,因其固有的简单性和可靠性在miRNA检测中受到广泛关注。然而,传统的EDC是单输出模式,信号放大的效率有限。因此,本研究提出了一种新型的EDC双输出模式,首先将其与DNAzyme级联,构建了一种熵驱动催化双端DNAzyme ( Entropy-driven catalysis dual end DNAzyme,EDC-DED)传感策略。该方法检测miRNA-21的线性范围为10 pM~1 nM,检测限低至2 pM,与传统的EDC单输出模式级联DNAzyme所构建的熵驱动催化单端DNAzyme ( Entropy-driven catalysis single end DNAzyme,EDC-SED)策略相比,表现出更好的信号放大效率和更高的检测灵敏度。同时,该方法具有优越的检测特异性和重复性,且在稀释血清样本回收实验中的回收率为97.26%~102.75%。<br>  随后,为了证明新型EDC双输出模式与其他扩增技术级联的通用性,本研究将其与杂交链式反应(Hybridization chain reaction,HCR)级联,构建了一种熵驱动催化双杂交链式反应(Entropy-driven catalysis dual hybridization chain reaction , EDC-DH )传感策略。该策略检测miRNA-21的线性范围为10 pM~5 nM,检测限低至8 pM,相较于基于传统EDC单输出模式级联HCR所构建的熵驱动催化单杂交链式反应(Entropy-driven catalysis single hybridization chain reaction,EDC-SH)策略,表现出更佳的放大效率。同样,该方法的检测特异性和重复性性能表现优秀,且在稀释血清样本回收实验中的回收率为95.32%~101.41%。<br>  综上,本研究基于新型EDC双输出模式分别级联DNAzyme和HCR成功构建了两种灵敏特异且简单快捷检测miRNA-21的新方法,具有良好的分析性能以及在稀释血清样本中检测miRNA的能力。此外,本方法可通过改变核酸序列与其他扩增技术级联,具有较强的通用性和临床应用前景。

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导师 陈辉
分类号 R730.43
发布时间 2024-12-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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