摘要目的:<br> 转录组测序研究胰腺癌放疗联合免疫治疗中的基因表达变化并筛选和验证其中的关键基因MX1。<br> 方法:<br> (1)构建胰腺癌荷瘤小鼠模型,再由转录组测序获取胰腺癌的转录组谱,进行数据质控,再对差异基因进行GO、KEGG及Reactome生物信息分析,Venn分析筛选目的基因。<br> (2)将目的基因结合公共数据库,筛选关键基因,通过公共数据库分析关键基因在胰腺癌中的表达情况以及与免疫浸润及免疫检查点之间的联系,同时绘制蛋白互相作用网络,揭示关键基因MX1在胰腺癌中相互作用的基因群,对相关基因群经GO富集分析从而推测相关作用机制。<br> (3)构建两种胰腺癌细胞系放疗联合免疫治疗的胰腺癌小鼠荷瘤模型,绘制肿瘤生长曲线,qRT-PCR法检测MX1在瘤体的表达水平。<br> 结果:<br> (1)对放疗联合免疫治疗差异基因进行GO分析,结果显示差异基因参与的生物过程主要包括生物调节、免疫系统等过程。分子功能方面则包括结合、分子功能调节剂。而KEGG的富集分析表明差异基因参与的通路包括信号转导、信号分子等方面。生物系统方面表现主要包括内分泌系统、免疫系统及循环系统。Reactome分析结果显示了差异基因参与的通路主要包括代谢、免疫系统、信号转导及基因表达。<br> (2)GEPIA数据库分析显示MX1在胰腺癌组织中的表达量较癌旁组织明显升高,提示MX1在胰腺癌中高表达。预后生存分析显示MX1与胰腺癌的预后呈负相关,并且MX1在胰腺癌中与免疫细胞浸润及相关免疫检查点呈正相关。<br> (3)蛋白相互作用网络揭示了关键基因MX1在胰腺癌中的相互作用的基因群包括OASL1、RSAD2、IFIT1、IFIT2、IFIT3,GO富集分析结果显示上述基因主要与细胞对干扰素α的反应等相关信号通路有关。<br> (4)两种不同胰腺癌细胞系的放疗联合治疗的小鼠荷瘤模型及qRT-PCR实验证实MX1在胰腺癌放疗联合免疫治疗中表达进一步上调。<br> 结论:<br> MX1 在胰腺癌中高表达,与预后呈负相关,与肿瘤免疫细胞浸润呈正相关。同时在胰腺癌放疗联合免疫治疗中高表达,在胰腺癌放疗联合免疫治疗后表达进一步上调,提示MX1表达与胰腺癌放疗联合免疫治疗耐受具有潜在的相关性,有望成为未来胰腺癌放疗联合免疫治疗中潜在治疗靶点。
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