摘要目的:研究泛素特异性蛋白酶 44(ubiquitin specific protease 44, USP44)在肝癌中的表达水平,USP44与肝癌病理分期及预后的关系,并研究其对肿瘤细胞生物学功能的作用。<br> 方法:利用临床组织标本进行实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR, qRT-PCR)实验,分析 40 例肝癌组织及其配对的癌旁组织中 USP44 mRNA 的表达水平,结合患者临床病理特征及qRT-PCR数据进行相关性分析和生存分析。检测USP44在肝癌细胞株中表达水平,使用慢病毒构建过表达USP44基因的HepG2和PLC5细胞株,通过qRT-PCR实验和蛋白质印迹实验分别检验USP44在肝癌细胞中过表达的效率。进行 Cell Counting Kit-8 细胞增殖实验和细胞克隆形成实验,检测USP44过表达对细胞增殖能力的影响;利用流式细胞仪进行细胞周期检测,检测细胞周期分布的变化。HepG2细胞株转录组测序结果对比分析,探讨差异表达基因及其涉及的分子功能、生物学过程及潜在作用机制等,通过qRT-PCR实验验证转录组测序结果。<br> 结果:USP44在肝癌组织中的mRNA表达水平显著低于癌旁组织(P=0.0001)。临床病理特征相关性分析发现:USP44表达水平和患者TNM分期相关,晚期(Ⅲ期和Ⅳ期)的肝癌组织的USP44表达量更低(P=0.026)。生存分析发现:USP44低表达水平的肝癌患者总生存时间更短(37.31月比52.68月,P=0.0471),无病生存时间也更短(3.91月比28.20月,P=0.0189)。USP44在肝癌细胞株中存在异常表达,其在HepG2中低表达,在Hep3B中高表达。通过慢病毒技术在HepG2和PLC5细胞中成功过表达USP44,在mRNA和蛋白水平分别成功检测。Cell Counting Kit-8 细胞增殖实验和细胞克隆形成结果显示:USP44 过表达后肝癌细胞的增殖受到明显抑制。细胞周期实验结果显示:USP44过表达后肝癌细胞周期被阻滞在G0/G1期。通过转录组结果分析,研究USP44的下游靶点和它调控肝癌细胞增殖的分子机制,发现了一组与增殖相关的基因簇,包括细胞周期蛋白 D (cyclin D, CCND) 2、细胞周期蛋白 G (cyclin G, CCNG) 2 和染色体结构维持蛋白 3(structural maintenance of chromosomes protein 3, SMC3)。Ingenuity Pathway Analysis 进一步绘制了 USP44 通过调节膜蛋白、受体、酶、转录因子和细胞周期蛋白,参与控制肝癌中细胞增殖、转移和凋亡的基因网络。qRT-PCR验证转录组结果显示:与转录组测序结果一致。<br> 结论:USP44在肝癌组织中呈低水平表达,与晚期肝癌及肝癌患者较差的生存率相关。过表达USP44能明显抑制肝癌细胞的增殖能力,阻滞细胞周期于 G0/G1 期并抑制肝癌的发生。USP44 可能通过参与Wnt/non-canonical planar cell polarity 信号通路抑制肝癌细胞的异常增殖,后续研究其稳定的底物蛋白将有重要意义。
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