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骨关节炎患者COVID-19感染潜在治疗靶点的生物信息学分析和初步验证

摘要背景: 2019 年严重冠状病毒病 (COVID-19) 及其随之而来的并发症的出现对人类安全提出了重大挑战。骨关节炎(OA)是最常见的退行性关节疾病,目前OA和COVID-19之间的分子机制尚不清楚。本研究旨在通过综合生物信息学分析这两种疾病之间潜在的分子机制,并确定对治疗COVID-19感染的OA患者有帮助的潜在药物。<br>  方法: 我们从GEO数据库下载COVID-19和OA数据集,并进行差异表达分析以获得DEGs。对COVID-19和OA的差异基因取交集,获得OA和COVID-19的共同基因。对这些共同基因通过Metascape进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,通过cytoscape筛选出hub基因并对这些基因进行实验验证。最后,通过共同差异基因鉴定了转录因子-基因相互作用、microRNA(miRNA)候选鉴定和候选药物鉴定。<br>  结果: 共获得94个共表达基因。DEGs的GO和KEGG富集分析表明,它们主要影响炎症,细胞因子和免疫相关功能以及炎症相关信号通路。通过分析PPI网络,我们获得了9个关键基因:COL1A1、COL1A2、BGN、MMP9、COL3A1、THBS1、SERPINE1、CXCL12、MMP1,并用独立数据库和实验验证他们。此外,筛选出按P值排名的前十名候选药物(黄体酮、染料木素、雌二醇、地塞米松、曲妥珠单抗A、维甲酸、地西他滨、双酚A、锌和阿糖胞苷),这可能有利于治疗COVID-19感染的OA患者。<br>  结论:本研究证明了OA和新冠肺炎之间的共同分子机制。并阐明与新冠肺炎和骨性关节炎滑膜病变相关的潜在机制。它们的共同途径和中心基因可能为进一步的研究提供线索。

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导师 杨雷
学位信息:
温州医科大学 临床医学 外科学(骨外科)(硕士) 2024年
发布时间 2025-02-17(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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