摘要目的:肾细胞癌占肾脏恶性肿瘤的80%~90%,而透明细胞癌则是肾细胞癌最常见的组织病理类型。虽然免疫疗法已经成为转移性肾细胞癌的重要治疗选择,但大多数患者并未从主流免疫疗法中获得持久的临床获益。可变多聚腺苷酸化(AlternativePolyadenylation,APA)在多种肿瘤的发生发展和免疫微环境中发挥着重要作用,但APA是否会影响透明细胞肾细胞癌(ClearCellRenalCellCarcinoma,ccRCC)的肿瘤免疫微环境(TumorImmuneMicroenvironment,TIME)目前仍不清楚。因此,本研究旨在通过生存分析和基因富集分析等方法探究APA调节因子对ccRCC的预后和TIME的影响。<br> 方法:通过对APA调节因子在ccRCC中的表达谱进行无监督聚类分析,将ccRCC患者分为两组(cluster1与cluster2)。使用R软件包clusterProfiler、immunedeconv和GSVA评估两组之间的预后、临床病理特征和TIME等方面的差异。接着研究APA调节因子与免疫检查点相关基因之间的关联,使用upSet图确认关键APA调节因子。然后分析关键APA调节因子小核核糖核蛋白70(SmallNuclearRibonucleoproteinU1Subunit70,SNRNP70)的表达与肿瘤免疫特征、已知生物过程等方面之间的相关性。最后使用survival、survminer、rms和timeROC软件包评估SNRNP70对预后的影响。<br> 结果:与cluster2相比,cluster1的病理TNM分期和组织病理分级更高,预后更差。ssGSEA分析表明,cluster2的免疫细胞浸润水平普遍较高。根据APA调节因子在ccRCC(相比于正常组织)和cluster1(相比于cluster2)中的高表达、与不良预后的相关性以及与CD274、CTLA4和PDCD1表达的相关性,在36个APA调节因子中确定关键APA调节因子。upSet图和热图显示,SNRNP70似乎是关键APA调节因子。与SNRNP70低表达组相比,高表达组的预后更差。然后比较SNRNP70高/低表达之间的肿瘤免疫特征发现SNRNP70低表达组的免疫浸润水平普遍较高。GSEA结果显示REACTOME_INTERLEUKIN_12_FAMILY_SIGNALING和WP_PPARALPHA_PATHWAY均富集在低表达组。此外,还进一步分析了已知生物过程与SNRNP70的相关性,以便更好地确定SNRNP70的潜在生物效应。结果显示,amp;nbsp;抗原处理机制(AntigenProcessingMachinery,APM)和同源重组(HomologousRecombination,HR)在高表达组中更为突出。因此,SNRNP70可能代表了一种新型的与免疫相关的ccRCC预后生物标志物。最后,泛癌分析表明,SNRNP70还可能通过影响TIME在其他类型的癌症中发挥作用。<br> 结论:本研究的数据表明,APA调节因子在ccRCC的免疫微环境中起着关键作用。SNRNP70是一种很有前景的预后生物标志物,也是ccRCC免疫疗法的潜在靶点。
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