摘要蛋白质N末端乙酰化修饰作为真核生物中广泛存在的蛋白质修饰类型之一,可以调控特定底物蛋白的功能。N末端乙酰化修饰由不同种类的N末端乙酰转移酶进行催化。Naa50为N末端乙酰转移酶E的催化亚基,以共翻译修饰的方式对底物蛋白进行N末端乙酰化修饰。课题组前期研究发现naa50-1突变体表现为植株矮缩、不育和主根长度变短等表型,在Naa50基因组的转基因互补实验中,naa50-1的发育缺陷表型得到完全恢复。为了探究Naa50通过对哪些底物蛋白进行乙酰化修饰进而调控植物发育,本研究通过两种策略对其底物进行检测:(1)利用商品化抗体Anti-Acetylmethionine,对含有N末端乙酰化的甲硫氨酸的肽段进行富集,通过质谱鉴定,比较野生型和naa50-1突变体中的差异肽段,获得Naa50的底物蛋白;(2)以AtNaa50.WholeGene::TurboID互补株系为材料,在TurboID的介导下,利用邻近标记技术探究拟南芥Naa50的特异性底物,阐明Naa50识别底物蛋白的规律。以上实验主要得到以下结果:<br> 1.Anti-Acetylmethionine不能有效富集起始甲硫氨酸被乙酰化的肽段<br> 为了探究拟南芥Naa50的底物,我们首先尝试利用Anti-Acetylmethionine对野生型和naa50-1突变体中N末端乙酰化甲硫氨酸的肽段进行富集,试图通过对比差异肽段筛选出Naa50的特异性底物。然而,当样品全蛋白经胰蛋白酶酶解、抗体富集和质谱鉴定后,并没有获得有效的质谱检测结果,可能是由于Anti-Acetylmethionine对N末端乙酰化肽段的富集效率低。<br> 2.利用邻近标记技术筛选出Naa50的特异性底物<br> 为了进一步探究拟南芥Naa50的特异性底物,在TurboID的介导下,以野生型和AtNaa20.WholeGene::TurboID互补株系幼苗为对照组材料,以AtNaa50.WholeGene::TurboID互补株系幼苗为实验组材料,利用邻近标记技术富集Naa50的特异性底物蛋白。通过不断优化生物素处理浓度和时间,最终选择降低生物素的浓度,延长处理时间,即20μmol·L–1生物素处理幼苗8d,质谱检测后发现,扣除掉对照组的蛋白肽段后,初步筛选到55种Naa50的特异性底物肽段。<br> 3.拟南芥Naa50识别底物的规律分析<br> 通过WebLogo3网站对筛选到的Naa50特异性底物蛋白N末端的前20个氨基酸进行氨基酸分布频度的分析,总结Naa50识别底物的规律。结果发现Naa50对起始的甲硫氨酸(M)以及第二位氨基酸主要为谷氨酸(E)和天冬氨酸(D)的肽段进行乙酰化修饰,表明Naa50主要识别前两位是ME和MD开头的氨基酸的规律。<br> 4.拟南芥mdf突变体与naa50-1突变体具有高度相似的表型<br> 通过分析筛选到的Naa50的特异性底物,发现了同时具有生物素修饰和N末端乙酰化修饰的剪切因子MDF,并且拟南芥mdf突变体与naa50-1突变体均具有植株矮缩、不育和主根长度变短等高度相似的缺陷表型,推测MDF是Naa50直接调控的底物。<br> 5.双分子荧光互补实验验证拟南芥Naa50与MDF的相互作用<br> 利用双分子荧光互补实验对Naa50与MDF之间是否具有相互作用进行验证,通过分别构建Naa50-YFPN、Naa50H115A-YFPN、Naa50Y77F-H115A-YFPN、Naa50H115A-Y127F-YFPN、Naa50Y77F-H115A-Y127F-YFPN载体以及MDFN-YFPC载体,转化农杆菌,共注射烟草后,在烟草叶片下表皮细胞质中观察到YFP荧光信号,并且阳性对照在细胞核与细胞质中均观察到YFP荧光信号,阴性对照YFPN与MDFN-YFPC共注射烟草后未观察到荧光,表明Naa50与MDF具有相互作用,推测Naa50可能通过对MDF进行乙酰化修饰而调控植株发育。<br> 6.拟南芥Naa50平衡植株生长发育和胁迫响应<br> 通过对拟南芥野生型和naa50-1突变体生长7d幼苗进行转录组测序分析,发现naa50-1与野生型之间存在表达差异性基因共5614个,包含表达显著上调基因3912个,表达显著下调基因1702个,其中上调基因主要响应病原菌和参与病原菌免疫防御反应,下调基因主要与光合作用、细胞周期与分裂相关,编码核糖体蛋白的mRNA的表达量也明显下调。暗示Naa50作为重要的调控蛋白,具有平衡植株生长发育和逆境胁迫应答的作用。<br> 综上所述,本研究利用邻近标记技术筛选出Naa50的特异性底物,阐明了Naa50识别底物蛋白的规律,并且发现拟南芥mdf突变体与naa50-1突变体具有高度相似的表型,同时通过双分子荧光互补实验验证Naa50与MDF具有相互作用,推测Naa50可能通过对MDF进行N末端乙酰化修饰而调控植株发育。此外,Naa50作为一个平衡器,对于平衡植株生长发育和逆境胁迫应答必不可少。
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