神经氨酸酶新型抑制剂的分子动力学研究-论文-万方医学网

神经氨酸酶新型抑制剂的分子动力学研究

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摘要流感是由流感病毒引起的一种严重影响人类生命健康的传染性疾病。近年来，H5N1高致病性禽流感呈现蔓延趋势，引起了全球人们的广泛关注。神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)是流感病毒表面的一种糖蛋白，在病毒的复制中起着重要的作用，是抗流感病毒药物设计的重要靶点。目前，常用的抗流感病毒药物有M2离子通道抑制剂和NA抑制剂。前者的缺点是会迅速出现耐药性，并且只对A型流感病毒有效。NA抑制剂中的奥司他韦在对抗流感病毒中发挥了决定性的作用。随着耐药性的不断出现，新型NA抑制剂的研究迫在眉睫。<br>　　本文通过分子对接和分子动力学模拟的方法研究了奥司他韦及其衍生物与神经氨酸酶之间的相互作用。分子对接方法可行性的验证结果表明，本实验选择的对接软件和设置的对接参数适用于所选择的体系。奥司他韦及其衍生物与神经氨酸酶的对接结果表明，配体分子与受体形成了稳定的复合物。在50ns的分子动力学模拟的过程中，三个复合物系统的均方根偏差(RMSD)轨迹均能够达到平衡状态。三个配体分子均与神经氨酸酶活性口袋附近的氨基酸残基形成了稳定的氢键，而且分子对接能量与结合自由能的计算结果均与实验测定的半数抑制浓度IC50的顺序相一致。神经氨酸酶活性位点附近的氨基酸残基ARG152、ARG292、ARG371和TYR347在抑制剂与神经氨酸酶的结合过程中起着重要的作用。本实验的研究结果为新型神经氨酸酶抑制剂的设计提供了理论参考，有助于流感药物的开发。