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摘要微型浮游硅藻是浮游植物中的重要类群，也是一类重要的海洋生物资源，但同时有些种类会引发赤潮，其中硅藻门的骨条藻属Skeletonema、海链藻属Thalassiosira、角毛藻属Chaetoceros等是比较常见的赤潮藻类。对这些重要的优势微型浮游硅藻种类的分类鉴定和遗传特性的研究，特别是分析这些典型种类的遗传地理差异，了解属内种间的遗传多样性，成为了海洋生态和赤潮研究的基础。 本文以我国沿海典型微型浮游硅藻属—骨条藻、海链藻、角毛藻的常见种类为研究对象，先分离并建立各个种的无菌纯种培养；然后利用光学显微镜、透射电镜和扫描电镜对其进行形态学观察、特征描述，并进行分类研究；再选择核糖体SSUnrDNA和LSUnrDNA基因对其进行分子生物学分析，包括基因序列差异性分析、遗传多样性分析和系统进化分析。旨在对我国沿海几种典型微型浮游硅藻进行形态学分类和分子鉴定，并分析其种间、种内、不同地理株系的地理遗传差异性和系统进化关系，探明我国沿海主要微型浮游硅藻的种类和遗传多样性水平。 本论文主要结果如下： 1、四种骨条藻的形态学、遗传差异及系统进化分析 分析了分离自深圳、香港、青岛、北黄海、厦门、长江口、广州和韩国等地的21株骨条藻。根据其形态学特征，鉴定为4个种：玛氏骨条藻SkeletonemamarinoiSarnoetZingone，多恩骨条藻SkeletonemadohrniiSarnoetKooistra，敏盐骨条藻Skeletonemasubsalsum(Cleve)Bethge和热带骨条藻SkeletonematropicumCleve。分析其nrDNA序列，并构建系统进化树，结果表明，热带骨条藻和敏盐骨条藻为单系的，而玛氏骨条藻和多恩骨条藻没有被区分开。因为玛氏骨条藻和多恩骨条藻种间差异非常小，SSUnrDNA序列的相似性非常高，整个序列相似性≥99.62％，而其它种类间的序列相似性在98.37％～98.93％之间。这两个种LSUnrDNA序列相似性≥99.11％，明显高于其它几种间的序列相似性(92.47％～96.3％)。 2、八种海链藻的形态学、遗传差异及系统进化分析 研究了分离自香港、海口、舟山、台湾海峡、胶州湾等地的20株海链藻。根据形态学特征鉴定为8个种，分别为极小海链藻ThalassiosiraminimaGaarder、威氏海链藻Thalassiosiraweissflogii(Grun．)Fryxell&Hasle、园海链藻ThalassiosirarotulaMeunier、细弱海链藻Thalassiosirasubtilis(Ostenfele)Gran、双环海链藻ThalassiosiradiporocyclusHasle、假微型海链藻ThalassiosirapseudonanaHasleetHeimdal、萎软海链藻ThalassiosiramalaTakano和艾伦海链藻ThalassiosiraalleniiTakano。nrDNA序列和系统进化树分析结果表明，支持细弱海链藻、假微型海链藻、极小海链藻、艾伦海链藻、威氏海链藻、萎软海链藻和双环海链藻为单系起源。威氏海链藻是8种海链藻中最早分歧的谱系，这说明威氏海链藻与其它7种海链藻遗传距离较大、亲缘关系较远。细弱海链藻和假微型海链藻的亲缘关系比较近。两个序列分析结果都显示双环海链藻与其它7种海链藻之间的差异最大，种间存在差异最大的两个种是威氏海链藻和双环海链藻(SSUnrDNA，6.57％；LSUnrDNA，12.82％)。差异最小的两个种是圆海链和细弱海链藻(SSUnrDNA，1.52％；LSUnrDNA，1.71％)。两个序列结果都表明细弱海链藻与假微型海链藻序列差异不大(2.00％～2.60％)。SSUnrDNA基因序列分析中，海链藻种内序列差异从0.13％到2.53％，LSUnrDNA基因序列分析的海链藻种内序列差异与SSUnrDNA基因序列分析中的结果相一致。 3、两种角毛藻的遗传差异及系统进化分析 对分离自香港、海口、黄海和厦门的4株角毛藻(形态学鉴定为2个种，旋链角毛藻ChaetoceroscurvisetiusCleve和短孢角毛藻ChaetocerosbrevisSchütt)进行遗传差异和系统进化分析。结果表明，SSUnrDNA基因序列分析中，旋链角毛藻与短孢角毛藻间的种间差异性为6.64％到10.77％，而旋链角毛藻种内的差异为0.18％到0.59％。角毛藻的SSUnrDNA基因组内存在多态性，旋链角毛藻的基因组内多态性平均为0.45％。LSUnrDNA基因序列分析中，短孢角毛藻与旋链角毛藻间的种间差异从17.15％～19.42％。而旋链角毛藻不同的地理株系也存在一定的遗传差异。