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摘要近来，有研究表明REGγ作为一种蛋白酶激活因子在癌症发生发展过程中起到重要作用。而迄今为止，已知的REGγ靶蛋白寥寥无几，与REGγ功能相关的信号通路亦不清晰。而公开的人体癌症组织DNA芯片数据(微阵列数据，microarray data)的数量与日俱增，质量也在不断提高。日趋成熟的数据挖掘技术使得利用这些高通量的数据进行相关生物信息分析并为生物实验研究提供支持成为可能。全局范围上的REGγ基因芯片研究的空白使得利用生物信息技术对REGγ的功能进行进一步的探索具有研究以及实用意义和价值。为了进一步了解REGγ在不同癌症类型中的表达情况，首先，我们采用免疫组织化学(Immunohistochemistry，IHC)的实验方法在四种不同的癌症组织中对REGγ的蛋白质表达水平进行测定。然后，我们采用关键词搜索的方法搜集了美国国立生物信息中心基因表达数据库(National Center of Biotechnology，Gene ExpressionOmnibus)中的来自4种癌症(包括肝癌，直肠癌，肺癌以及甲状腺癌)的共23个数据集的1，070个人类癌症组织样本基因表达数据并进行分析，试图寻找REGγ在不同癌症类型中的基因差异表达模式。我们进一步采用皮尔森相关系数(Pearson Correlation)来估计在这些数据集中与REGγ表达相关的基因集。我们在相关分析的基础上，对这些基因进行了信号通路分析(pathway analysis)、生物功能注释(functionalannotation)。为了对预测结果进行评估和验证，文中采用qRT-PCR技术在肿瘤细胞系以及人类大肠癌组织中对这些与REGγ表达高度相关的基因进行表达水平的验证。最后，再次在人类大肠癌组织中利用免疫组化证明了部分REGγ高度相关基因的蛋白质表达水平与预测结果的一致性。研究结果表明：在本文所研究的四种癌症(肺癌、结肠癌、甲状腺癌、肝癌)中，REGγ在50％以上的癌症组织中存在蛋白质水平的差异表达(免疫组织化学实验)。对所有基因芯片数据集的分析表明，在所有的癌症类型中REGγ在基因水平的表达也存在类似的差异情况，即REGγ在基因水平存在差异表达。同时，相关性分析以及信号通路分析表明，REGγ与p53信号通路中的许多基因，以及其他多种癌症相关信号通路中的基因存在显著的相关关系。RT-PCR实验进一步验证了以上预测。对REGγ相关基因的网络分析再次强调了REGγ与Myc的高度相关关系，对人体结肠癌组织进行的免疫组化实验所得结果再次验证了这一相关关系。我们的研究证明了REGγ在多种癌症类型的差异表达。这项研究为我们了解REGγ在多种癌症中的表达提供了新的线索，并将REGγ基因的差异表达与癌症相关信号通路联系起来。我们的研究结果表明REGγ在多个癌症信号通路中存在潜在的致病机理，很有可能作为一个癌症标记物。<br>　　 <br>