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解旋酶Pif1与DNA/RNA复合物的晶体学研究

摘要Pif1家族是一种ATP依赖性的核酸解旋酶,包括酿酒酵母中的ScPif1、裂殖酵母中的SpPfh1、小鼠中的mPif1、人类中的hPif1等成员,能够结合和解旋G4结构、单链和双链DNA、DNA-RNA杂合链等核酸底物,在染色体稳定性、端粒代谢、基因的复制、线粒体的功能、基因的转录等方面具有重要的作用和生理功能。为了通过晶体学的方法研究Pif1家族及其复合物的结构,本研究使用大肠杆菌,克隆和表达了鼠源、酵母、人源等4种Pif1的全长或者截短后的蛋白。通过亲和层析和凝胶过滤层析等方法,纯化得到了mPif11-200,hPif1200-641,SpPfh1305-805,SpPfh1305-790,ScPIF140-859,ScPIF140-859-K264A等6个截短后Pif1蛋白,其中hPif1200-641具有较高的纯度,并且稳定均一,适于结晶。通过EMSA和Ge1 filtration等方法鉴定了hPif1200-641与不同核酸底物的结合效率,选择出最佳的DNA和RNA底物,纯化得到蛋白与核酸的复合物,进行共结晶。经过优化,得到蛋白hPif1200-641及其复合物的棒状单晶。其中hPif1200-641的蛋白晶体X衍射分辨率较高,可以达到3.5(A),属于P321空间群,晶胞参数为:a=b=204.4(A),c=77.93(A),α=90°,β=90°,γ=120°。该研究有助于阐明Pif1结合和解旋DNA和RNA的机制,为接下来的功能学研究奠定了坚实的基础,从而揭示其相关的的生理学功能及分子机理。

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