摘要本实验室的前期研究指出,通过表达外源转录因子Foxa3、Gata4和Hnf1α可诱导小鼠成纤维细胞转分化重编程为肝细胞类似细胞(iHep)。而以往的工作指出,分化细胞之间含有相同的基因组遗传信息,造成这些细胞表型和功能差异的原因主要是由于这些细胞间不同的表观遗传修饰信息。体外转录因子诱导的细胞重编程能够快速实现细胞特异的表观遗传修饰重建,为阐明重编程过程中组蛋白修饰等表观遗传的改变,以及为揭示转分化具体的分子机制提供了研究系统。<br> 本项目将以成纤维细胞肝向转分化重编程过程作为研究体系,拟采用染色质免疫共沉淀-深度测序(ChIP-seq)技术,检测转录因子在基因组上的结合位点,以及组蛋白H3的修饰情况,同时监测转分化过程中全基因组表达谱的变化,进而建立起转录因子、组蛋白修饰及表达谱之间的相互关系。并通过对全基因组表达谱的分析,寻找直接响应体外转录因子的下游蛋白。以期对肝向转分化过程中的分子机制获得更深入的理解。
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