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肌萎缩侧索硬化的基因突变研究

摘要肌萎缩侧索硬化(amyotrophic lateral sclerosis,ALS)是一种致死性的神经退行性疾病,通常累及大脑皮质、脑干和脊髓前角的上、下运动神经元,导致肌肉无力和萎缩、言语困难及呼吸功能障碍。目前,全世界已发现的ALS致病基因主要有30余个,SOD1、FUS、TARDBP和C9ORF72基因最为常见。其中,C9ORF72基因非编码区的六核苷酸重复扩增突变GGGGCC(G4C2)是西方国家ALS与额颞叶痴呆(frontotemporal dementia,FTD)的最主要原因。此外,ATXN2基因编码区的三核苷酸(CAG)n重复扩增也是ALS发病的风险因素之一。<br>  目的:<br>  (1)应用高通量测序技术检测ALS目标基因突变,明确ALS患者常见的突变基因及其突变率。<br>  (2)检测C9ORF72基因的非编码区G4C2突变和编码区突变,初步分析C9ORF72基因在ALS中发挥的作用。<br>  (3)明确ATXN2,ATXN3,AR基因编码区和ATXN8基因非编码区的(CAG)n重复扩增与ALS是否有关。<br>  方法:<br>  (1)应用Ion Torrent测序平台进行靶向重测序,目标基因panel包括26个ALS明确致病基因及相关易感基因的全部外显子区域。筛选ALS候选致病基因突变及初步分析其致病性,明确常见突变基因及突变频率。<br>  (2)采用Repeat-primed PCR扩增C9ORF72基因G4C2重复扩增区域,使用ABI3730 DNA Analyzer仪器和GeneMapper软件分析G4C2重复次数。通过体内cDNA测序和体外Minigene检测两种方法确定C9ORF72基因的剪接位点变异c.601-2 A>G的致病性。<br>  (3)扩增ATXN2、ATXN、ATXN和AR基因的(CAG)n重复扩增区域,确定(CAG)n在ALS患者和健康对照中的重复次数,通过统计学方法分析(CAG)n重复扩增突变与ALS是否有关。<br>  结果:<br>  (1)我们在7例FALS患者(38.89%,7/18)和33例SALS患者(18.54%,33/178)中检测到36种基因突变类型,包括1个剪接位点突变,1个无义突变和34个错义突变。FALS患者携带的基因突变分布在ALS明确致病基因SOD1、UBQLN2和VAPB中,其中突变频率最高的基因为SOD1(27.78%)。SALS患者中14例(7.87%,14/178)携带ALS明确致病基因的突变,SOD1突变频率最高。其余19例SALS患者(10.67%,19/178)携带ALS相关基因的突变,其中频率最高的是NEFH(3.93%)。<br>  (2)我们发现2例SALS患者(0.79%,2/252)携带C9ORF72基因的G4C2重复扩增突变(大于30次)。统计学分析结果显示该重复扩增突变在中国ALS患者和健康对照中的分布情况没有显著性差异(p=0.805)。此外,我们发现了C9ORF72基因的一个剪接位点突变(c.601-2A>G)。体内cDNA测序及体外MiniGene实验结果均显示出该突变破坏了第4内含子中的剪接受体位点,使第5外显子中隐匿剪接受体位点激活,可能导致成熟mRNA中缺失四个核苷酸(c.601_604 del ATAG),读码框发生移位并提前出现终止密码(p.I201fsX235); cDNA测序结果还显示出无义介导的mRNA降解(Nonsense-Mediated mRNA Decay,NMD)。该突变为C9ORF72基因编码区突变的首次发现,也为Loss-of-Function致病机制提供新证据。<br>  (3)我们发现ATXN2基因的(CAG)n长片段重复(>32次)在ALS患者和正常人中分布有显著性差异(p=0.028),而中间片段(24-31次)没有(p=0.839); ATXN8基因的(CAG)n中间片段(29-67次)和ALS疾病有关(p=0.0130);ATXN3和AR基因的长片段、中间片段和短片段重复均和ALS无关。<br>  结论:<br>  (1)本研究发现FALS和SALS患者中突变频率最高的基因均为SOD1,FALS和SLAS突变谱存在明显差异。<br>  (2)C9ORF72基因的六核苷酸重复扩增突变G4C2不是中国ALS患者的常见基因突变类型。<br>  (3)发现一个C9ORF72基因剪接位点突变c.601-2A>G,为ALS的Loss-of-Function致病机制增加新证据。<br>  (4)ATXN2基因的(CAG)n长片段(>32次)和ATXN8基因的中间片段(29-67次)可能与ALS有关。ATXN和AR基因的(CAG)n突变与ALS无关。

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导师 张学
学位信息:
北京协和医学院中国医学科学院北京协和医学院;中国医学科学院;清华大学医学部 基础医学 医学遗传学(硕士) 2015年
分类号 R746.4R741.02
发布时间 2016-11-17
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