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中国杨属物种DNA条形码及分子系统学初步研究

摘要杨属物种由于严格的异交性质和广泛的种间杂交使得根据形态特征很难区分。DNA条形码是一种通过标准的DNA片段来实现物种快速鉴定的方法,因此杨属物种的DNA条形码研究有利于天然种质资源的鉴别和保护。<br>  本研究对中国杨属17个代表种69个样本选取核基因组片段ITS、DSH10、DSH28和叶绿体片段matK、ndhF、ycfl、atpH-atpI进行DNA条形码研究,结果表明单拷贝核基因DSH10和DSH28和ITS的物种区分能力相当,都要明显优于叶绿体片段,无论是单片段还是多片段组合,其中三个核基因组片段组合的物种分辨率最高(47.06%),能够区分出胡杨(Populus euphrantica)、毛白杨(P.tomentosa)、辽杨(P.maximowiczii、山杨(P.davidiana)、囡叶杨(P.rotundifolia)、梧桐杨(P.pseudomax imowiczii)、大叶杨(P.lasiocarpa)和三脉青杨(P.trinervis),表明核基因组片段更适合杨属物种的鉴别。最高物种分辨率的片段组合仍然不能区分一半的物种,因此需从技术方法上进行改进,本研究推荐引入特殊的阶层条形码系统进行物种鉴定,即从类群水平到物种水平实现物种的分阶段鉴定,其中在类群水平上可使用核基因组片段如ITS和DSH28,而在物种水平上推荐使用SNPs技术。<br>  通过扩增测序中国杨属20个种的DSH22和DSH10及21个种的ITS片段(其中13个种为本文条形码研究的物种),结合GeneBank中相关的DSH10、DSH22、matK和trnH-psbA的数据,对中国杨属物种进行系统发育分析,结果表明胡杨组(section Turanga)为杨属的基部类群,白杨组(section Populus)为单系类群,大叶杨组(section Leucoides)物种长序杨(P.pseudoglauca)在核基因和叶绿体基因的系统树中都与青杨组(section Tacamahaca)物种有较近的亲缘关系表明其应为青杨组物种,大叶杨组与青杨组、黑杨组(section Aigeiros)亲缘关系较近,其中青杨组和黑杨组往往共同占据系统发育的末端亲缘关系最近,叶绿体基因及核基因的系统发育分析表明青杨组和黑杨组很可能为杂交起源且青杨组为多系起源。根据以上构建的进化树加上各个物种的地理分布,将中国杨属物种初步分为7个类群,依次为胡杨组类群,大叶杨组类群,白杨组类群,黑杨青杨类群,东北青杨类群,西南青杨类群1,西南青杨类群2,该分类将有助于杨属DNA条形码的研究和数据库的构建。

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