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摘要本研究运用DNA条形码(DNA barcoding)检测技术，选取叶绿体基因组中的序列rbcL，matK,trnH-psbA序列与核基因组中的ITS，ITS2序列作为DNA条形码候选片段，验证其对山茶属植物的应用效力，以期在不受外部形态、发育阶段限制的条件下准确、快速、大规模地对山茶属植物进行鉴定，分析其亲缘关系及物种演化进程。<br>　　采集山茶属植物18个组共64个植物样品，提取基因组DNA并用于序列的扩增，山茶属植物组织含有较多的糖类、多酚类、单宁、蛋白质等次生代谢物质，在提取植物DNA时，能够与DNA分子发生特异地结合，从而污染样品。本试采取改良的CTAB法，对山茶属植物DNA提取具有较好的效果。主要结果如下:<br>　　1.叶绿体基因序列rbcL,matK和trnH-psbA能够成功扩增和测序，引物的通用性、序列的测定成功率高;而基因组序列ITS和ITS2序列引物通用性不高，有较多杂带出现，PCR产物出现了结合和杂合的问题，导致测序失败。ITS序列难以扩增的现象较普遍，推测可能的原因是山茶属植物核基因组中存在多拷贝现象，或是引物特异性不强，致使PCR扩增产物杂带过多，无法获得正确序列信息。叶绿体基因rbcL，matK和trnH-psbA序列在山茶属基因扩增中较易获得，引物适用性高，可作为候选DNA条形码片段。<br>　　2.本研究共获得山茶属内物种的rbcL序列61条，长度为569bp;matK序列64条，长度为846bp;trnH-psbA基因序列62条，长度为491bp，其中，trnH-psbA序列含有最多、的变异位点(156)。<br>　　3.单一序列rbcL，matK和trnH-psbA在山茶属内的鉴定效率分别为29.51％、10.94％和32.26％，并且能够成功区分不同属植物。选取米碎柃木(Eurya chinensis)、红淡比(Cleera japomca)、厚皮香(Ternstroemia gymnanthera)、碧桃(Prunus persica)、木蓝属植物Indigofera aspalathoides、爱玉子（Ficus pumla var.Awkeotsang）和石榴(Punica granatum)为外类群时，三个基因片段都能在属的水平将物种正确鉴定，rbcL，matK和trnH-psbA的属间鉴定成功率分别为75％，87.50％和87.50％。<br>　　4.组合序列中，matK+rbcL对于山茶属植物具有最大的物种鉴别率(36.07％)，组合序列的鉴定结果与单一片段相似。结果表明，山茶属植物的保守性较大，山茶属植物中实果茶组、茶组、金花茶组、红山茶组和超长柄茶组变异率较大，能够正确鉴定。