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摘要蝎类因其独特而极为保守的外形和功效强大的毒液，一直被认为是节肢动物中的标志性类群之一。隶属于钳蝎科(Buthidae)的东亚钳蝎Mesobuthus martensii(Karsch，1879)在中医药中有着悠久的使用记录，当代研究已证明其毒液中富含多种生物活性物质。该物种是东亚特有种，主要分布于中国暖温带地区，扩散能力弱，是生物地理演化研究的理想模型。然而，对东亚钳蝎的遗传多样性和演化历史的了解还很局限，例如此前的研究只是利用一条短的线粒体DNA片段和一些细胞核基因标记，还没有完全解析东亚钳蝎的遗传谱系分化和各谱系间的进化关系。本研究拟通过基因组重测序，深入地解析东亚钳蝎的谱系分化，并以毒素基因和线粒体假基因(NUMT)为切入点初步探索各谱系的基因组进化特点。<br>　　本文对具有地理代表性的33个东亚钳蝎(M.martensii)和一个条斑钳蝎(M.eupeus)样品进行了基因组重测序，每个样品测序平均覆盖度大于30×。通过跟东亚钳蝎的参考基因组比对，找到了基因组范围上4，611，232个纯合的单核苷酸多态位点(SNPs)。之后，基于细胞核全基因组SNPs重建了东亚钳蝎谱系的系统发生关系。结果表明太行山西部的东亚钳蝎形成一个单系群，而太行山以东的东亚钳蝎则分成多个谱系。同时，本文也利用13个线粒体蛋白质编码基因序列，构建了东亚钳蝎谱系的最大似然和贝叶斯系统发生树。线粒体系统发生树的主要谱系和基于SNPs构建的系统发生树总体上一致。<br>　　本文基于邻接法和最大似然法构建了东亚钳蝎49条钠离子通道毒素(NaTxs)编码区序列系统发生树，发现β-毒素分支位于系统发生树的基部。本文还利用东亚钳蝎和条斑钳蝎的SNPs数据分析了种间和种内的NaTxs多样性，种间的非同义取代和同义取代的数量都要明显高于种内。与M.martensii相比，M.eupeus的毒素多样性可能更高。<br>　　本文对东亚钳蝎的NUMT进行了研究。发现56％～84％的东亚钳蝎谱系的线粒体控制区，12S rRNA，tRNAval和16S rRNA等基因发生了向细胞核基因组的转移。本文还发现了一些谱系特有的NUMT，包括ND4、ND1、ND4L和ND2基因。正如所期望的那样，在NUMT-mtDNA系统发生树上，这些NUMTs序列形成一个单系群。<br>　　此外，在开展上述研究的过程中，作者还首次发现了蛆症异蚤蝇Megaselia scalaris(Loew，1866)对条斑钳蝎蒙古亚种M.eupeus mongolicus(Birula，1911)和酱麻蝇Sarcophaga dux(Thompson，1869)对东亚钳蝎的寄生现象，本文的结果揭示了双翅目(Diptera)和蝎目（Scorpiones）之间的营养关系。