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以BioID为技术基础研究病毒与宿主蛋白的相互作用

摘要病毒入侵宿主细胞始于病毒与宿主细胞表面受体之间的相互作用;进入宿主细胞后,病毒借助宿主蛋白完成自身基因组的复制、蛋白的合成,以及新病毒颗粒的组装、释放等过程。病毒生活周期的每一步都离不开与宿主蛋白之间的互动。因此研究病毒与宿主蛋白之间的相互作用情况,对于揭示病毒的感染机制具有重要的意义。<br>  本研究以大肠杆菌生物素连接酶的突变体BirA*作为技术基础,研究病毒蛋白与宿主蛋白之间的相互作用。BirA*具有距离依赖性生物素化功能,即细胞内与BirA*在空间位置上接近的蛋白能够被其生物素化标记,科学家利用BirA*这一特性,建立了一种研究蛋白质相互作用的方法,取名为BioID。利用此方法,将BirA*与病毒蛋白构建成为融合蛋白表达在病毒的宿主细胞中,被BirA*标记的蛋白质通过链霉亲和纯化分离出来,就得到潜在的相互作用蛋白质。将埃博拉病毒的四个基质蛋白VP24、VP30、VP35和VP40分别与BirA*构建成融合蛋白,转入HEK293T细胞和THP-1细胞中,来研究病毒与宿主细胞内蛋白的相互作用,通过标记、纯化、质谱分析得到潜在的相互作用蛋白质,对其中一部分数据进行验证,得到与埃博拉病毒VP24蛋白相互作用的宿主蛋白质Nup85、Nup62和CPT2。<br>  同时,提出一个构想,利用BirA*建立一种新的技术方法,研究病毒与细胞表面蛋白之间的相互作用,即利用BirA*寻找病毒受体。为了验证方法的可行性,将SARS-CoV的S蛋白受体结合区RBD与BirA*构建成融合蛋白,用一定的方法灵活地定位在细胞膜表面,试图用融合蛋白标记并纯化出SARS的已知受体ACE2。由于方法还未建立成熟,目前尚未在被标记的蛋白质中检测到ACE2蛋白。其中存在着一些需要改进的问题。

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导师 李朝阳
学位信息:
中国科学院大学 生物学 生物化学与分子生物学(硕士) 2017年
分类号 R373
发布时间 2018-06-29
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