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捕获测序对质谱筛查阳性新生儿基因诊断的有效性研究

摘要作为最成功的公共卫生预防计划之一,新生儿筛查的目的是对人群中一些严重的遗传性代谢紊乱进行筛查。通过早期发现遗传代谢病,使患者被及时诊断和治疗患者,避免不可逆的身心发育障碍,降低新生儿发病率和死亡率,减少出生缺陷。串联质谱检测技术是当前筛查新生儿遗传代谢病的重要技术。该技术仅在短时间之内利用一次检测分析干血片中多种氨基酸、游离肉碱、酰基肉碱等物质,能对几十种遗传代谢病进行检测。二代测序技术逐渐被运用到新生儿遗传代谢疾病的筛查中辅助临床确诊,尤其是相对于特定一组疾病的检测,目标区域捕获测序技术表现出优势。<br>  目的:研究目标区域捕获测序技术整合到当前基于串联质谱技术的新生儿筛查体系中的可行性。建立联合目标区域捕获测序技术和串联质谱技术的新生儿筛查-诊断模型。同时我们对该整合的筛查-诊断模型的表现进行评估。对经基因确诊的样本,分析其遗传代谢病的基因特征,以帮助后续的遗传咨询和解读,展开个性化的治疗方案。<br>  方法:选取来自天津地区约2年内,未能被常规新生儿筛查体系流程确诊,且经过串联质谱筛查结果提示指标异常,初筛疑似阳性的干血片样本。对干血片样本进行质量控制,最终对符合要求的60例样本进行目标区域捕获测序技术研究。目标区域捕获测序技术的捕获芯片(panel)覆盖87种孩童期比较常见的先天性遗传代谢疾病(169个基因)。利用目标区域捕获测序技术检测经串联质谱技术筛查后提示氨基酸或酰基肉碱水平异常的干血片样本。对检出的突变位点的进行sanger验证。对联合目标区域捕获测序技术和串联质谱技术的新生儿筛查-诊断模型进行经济效益分析。<br>  结果:目标区域捕获测序技术整合串联质谱技术的新生儿筛查-诊断模型诊断结果提示26例样本为阳性患者,11例样本具有较高遗传代谢病患病风险,9例样本患病风险较低,14例样本为阴性。同时,该整合模型通过基因诊断了5例不能被当前的常规串联质谱筛查检出的样本,对当前的筛查体系流程进行了很好的补充。该整合筛查体系经济效益比为1∶2.64~7.92。<br>  结论:1.基于干血片的目标区域捕获测序技术能快速确认和诊断被常规串联质谱筛查流程遗漏的潜在高危患者。2.整合基于干血片的目标区域捕获测序技术到当前的串联质谱筛查流程体系有助于提高对先天性遗传代谢病患者和携带者的(辅助)确认。3.通过分析发现,当前的串联质谱筛查体系可以通过整合串联质谱和目标区域捕-获测序技术体现出良好的经济成本效益。

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