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KSHV病毒感染早期分子事件研究及上海市区肝癌数据分析

摘要第一部分<br>  卡波氏肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)感染的早期分子事件是一个十分复杂的过程,涉及了病毒与受体相互作用、细胞内病毒转运以及最初的病毒和宿主基因相互作用等各个方面。虽然对KSHV感染的早期分子事件已经有不少研究,但其机制仍未完全阐明。<br>  为了进一步研究KSHV感染早期分子事件和探究参与该过程的功能基因,我们利用微阵列技术(Microarray)对KSHV离心感染的4个不同时间点(12h、24h、48h、72h)的人脐静脉内皮细胞(HUVEC)和正常人细胞进行全基因组基因表达谱分析,共检测到2688个差异表达的基因(differential-expressed genes,DEGs,倍差≥2.0,p<0.05)。此外,通过Gene ontology (GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)分析将这些DEGs富集到48个生物功能方面及12条信号通路上。生物功能方面涉及到对创伤的反应、对刺激的反应、细胞外区域的反应、免疫系统的反应、细胞因子的活性、生长因子的活性等;信号通路包括MAPK信号通路、细胞因子与其受体相互作用通路及NF-κB信号通路等。在这些DEGs中,我们发现了一些具有潜在重要功能的基因,如激活转录因子3 (activating transcription factor 3,ATF3)。ATF3属于激活转录因子(activating transcription factor,ATF)家族,在KSHV感染早期上调表达。进一步研究发现过表达ATF3后再进行KSHV从头感染会引起KSHV潜伏和裂解期基因的大量表达及导致宿主细胞的凋亡。此外,为了抵抗宿主细胞凋亡的免疫反应,KSHV编码了LANA和K8蛋白来共同抑制ATF3的表达。本研究有望为进一步了解KSHV感染的早期分子事件提供新的线索。<br>  第二部分<br>  上海市区2012年肝癌在男性和女性人群中分别排在第五位和第八位,造成了较大的社会负担。本研究旨在基于上海市区过去40年的肿瘤登记数据,描述和分析肝癌发病和死亡的变化情况,并对未来的趋势进行预测。从上海市肿瘤登记系统中提取1973-2012年上海市区肝癌发病和死亡数据,并利用年龄-时期-队列模型对数据进行分析。在1973-2012年间,上海市区共有66036例肝癌病例,其中,男性47344例,女性18692例。男性的年龄调整发病率为26.89/100 000人,女性为8.89/100 000人。相应的,在此时间段内,共有62439位患者因肝癌死亡,其中男性死亡数为44355,女性死亡数为18084。经年龄调整后,男性死亡率为25.34/100 000,女性为9.39/100 000。除0-19岁组,其余年龄组人群的肝癌发病率和死亡率均表现为下降趋势。对肝癌数据进行预测的结果表明,在2013-2020年间,上海市区肝癌的发病率和死亡率将进一步下降,但是发病人数和死亡人数变化不大。过去四十年中,上海市区肝癌的发病率和死亡率分别下降了40%和50%,这一下降趋势将在未来几年中一直持续。虽然肝癌发病和死亡年龄调整率在下降,但是粗率却在上升,这反映了上海市区人口老龄化程度在加重。

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导师 蓝柯
学位信息:
中国科学院大学 生物学 微生物学(博士) 2018年
分类号 R735.7
发布时间 2019-07-12(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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