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HDAC6及METTL3在肝癌和病毒免疫应答中的机制研究

摘要机体的稳态受到免疫系统的精密调控。免疫应答包括天然免疫应答和适应性免疫应答,能够通过识别内源肿瘤细胞及外源微生物感染等引发机体的免疫反应,从而达到清除肿瘤细胞或微生物等的目的。因此,研究免疫系统调控抗肿瘤及抗病毒的机制有着重要的科学意义。在这一过程中,表观遗传学修饰参与并发挥着重要作用,但其调控机制仍有待进一步研究。本论文基于多种体内体外生物学模型,研究了表观遗传学修饰基因在机体调控抗肿瘤免疫及抗病毒天然免疫过程中的作用机制,分述如下:<br>  1)靶向HDAC6重编程TH17细胞效应功能并促进肝癌的免疫治疗<br>  肝脏是人体重要的代谢器官且能够形成高度耐受的免疫微环境。研究表明,虽然肝癌患者癌组织中有大量免疫细胞浸润,但大都处于低或无应答的状态,因此,深入研究肝癌微环境中免疫耐受的调控机制具有重要的科学意义及临床价值。组蛋白去乙酰化酶(HDACs)是重要的表观遗传学修饰因子,其抑制剂已被广泛的应用于肿瘤的临床治疗。但是,HDAC基因是否通过调控肝癌免疫耐受影响肝癌的进程尚不十分明确。<br>  我们首先通过TCGA、GEO数据库及qRT-PCR比较18个HDAC家族基因在肝癌及癌旁组织的差异表达,筛选发现HDAC6在癌/癌旁中差异表达最显著。免疫缺陷的Rag1-/-小鼠皮下荷瘤实验表明,HDAC6基因对肝癌细胞体内成瘤并没有显著影响,而免疫健全的HDAC6敲除小鼠相比于野生型小鼠能够显著的抵抗肝癌细胞的体内成瘤,这说明HDAC6可能是通过影响免疫微环境来调控肝癌的进程的。进一步通过流式细胞术对免疫系统进行分析发现,HDAC6通过其去乙酰化酶活性特异的抑制了TH17细胞的分化及抗肿瘤免疫应答。过继转移HDAC6敲除的TH17细胞能够通过上调的IL-17A促进抗肿瘤细胞因子的分泌及CD8+T细胞介导的抗肿瘤能力。有趣的是,HDAC6敲除的荷瘤小鼠能够上调肿瘤组织中PD-1-PDL-1的表达来负反馈的抑制免疫应答。因此,联合anti-PD-1抗体治疗能够进一步打破这种抑制作用并促进机体抗肝癌免疫应答。机制上,HDAC6通过调控FoxO1蛋白赖氨酸K242位点来维持FoxO1的细胞核转位及蛋白的稳定性,从而抑制TH17细胞转录因子RoRγt的活性。最后,我们证实了HDAC6-FoxO1信号通路调控机制在人和鼠的TH17细胞中是高度同源的。<br>  总结以上结果,我们的研究阐明了靶向HDAC6-FoxO1信号轴能够重编程TH17细胞分化,通过改善肝癌免疫耐受微环境促进肿瘤免疫治疗效果的机制。本研究丰富了组蛋白修饰对调控肝癌免疫耐受的认识,为微环境免疫耐受机制的研究提供了新的研究思路和方向,为肝癌的临床治疗提供新的理论基础及应用策略。<br>  2) METTL3介导m6A修饰通过破坏病毒RNA双链结构制天然免疫识别<br>  病原性RNA病毒能够感染机体并严重威胁人类健康。天然免疫是人体抗病毒免疫应答的第一道防线。因此,从机制上揭示RNA病毒和宿主天然免疫上的相互作用有着重要科学意义。机体为了维持稳态,能够对入侵体内的病毒进行免疫清除。在启动适应性免疫之前,高度保守的天然免疫能够首先对病毒的组分进行识别并起始抗病毒反应。病毒产生的单链RNA能够形成二级结构促发Rig-like受体(RLRs)(包括RIG-Ⅰ及MDA5)识别并启动抗病毒天然免疫应答。因此,研究病毒逃逸宿主天然免疫识别机制,并找到相应的靶点对临床抗病毒药物研究有着重要的指导意义。<br>  RNA m6A修饰是mRNA上丰度最高的表观遗传学修饰,但这一修饰在病毒RNA引发的RLRs识别过程中的功能依然不清楚。METTL3是重要的RNA m6A甲基化转移酶,它通过催化细胞内源RNA m6A修饰调控mRNA稳定性、翻译、亚细胞定位等,从而影响多种生命过程。我们通过“功能获得”实验发现,过表达METTL3能够显著的抑制VSV病毒诱导的Ⅰ型干扰素产生。进一步研究发现,在VSV感染过程中,METTL3能够从细胞核转位到细胞质,直接与VSV的正义链RNA产生相互作用并进一步介导病毒RNA m6A修饰。dsRNA-RIP等实验发现,METTL3介导的RNA m6A修饰破坏了VSV病毒dsRNA形成,使得dsRNA感应器RLRs识别受阻从而抑制天然免疫信号的活化。免疫印迹及RNA-seq结果显示,METTL3能够广泛的抑制VSV引发的天然免疫上游及下游信号通路并且这一表型完全依赖于METTL3介导的m6A修饰。进一步通过构建单核细胞METTL3特异性敲除小鼠及肝脏细胞METTL3特异敲除小鼠进行体内功能实验发现,METTL3的缺失能够促进小鼠上调Ⅰ型干扰素信号,抵抗VSV的感染。因此,我们的研究从体外及体内多个模型及分子机制共同说明了METTL3介导的RNA m6A修饰对机体抗病毒天然免疫的抑制作用。<br>  总结以上结果,METTL3可通过其m6A转移酶活性抑制宿主细胞天然免疫的活化,促进病毒的免疫逃逸。我们的工作首次阐述了一个新的天然免疫调控机制,即病毒入侵宿主后产生的RNA可以通过与宿主METTL3蛋白相互作用并介导病毒RNA m6A修饰,改变病毒RNA的双链结构从而削弱RLRs的识别,为RNA病毒免疫逃逸机制的研究提供了新的研究思路和方向,METTL3的m6A转移酶活性位点也有望成为未来临床抗病毒药物研发的新靶点。

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导师 杨鹏远
学位信息:
中国科学院大学 生物学 细胞生物学(博士) 2020年
发布时间 2020-10-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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