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摘要荧光假单胞菌（fluorescent Pseudomonas strains）是一类常见的植物根际促生细菌，对植物的营养转化、抗病免疫、抵御胁迫、品质提升具有重要作用。近年来从许多荧光假单胞菌中发现了多个拷贝的鞭毛蛋白，以及类似于鞭毛装置的Ⅲ型蛋白分泌系统(T3SS)。本论文以两个典型的荧光假单胞菌F113和2P24为对象，通过遗传突变和性状检测，初步明确了多拷贝鞭毛蛋白和T3SS在运动性、促生和植物互作中的功能。主要研究结果如下:<br>　　将荧光假单胞菌F113的两个鞭毛蛋白分别命名为FliC-1和FliC-2，两条氨基酸序列同源性为45.04％，Flg22氨基酸肽段的同源性为81.82％。构建F113鞭毛蛋白编码基因突变体F113△fliC-1、F113△fliC-2、F113△fliC-1△fliC-2。经检测，F113△fliC-1丧失了运动能力，而F113△fliC-2的运动能力没有显著变化;与野生型F113相比，F113△fliC-1完全丧失激发植物免疫抗性的能力，而F113△fliC-2保留了激发植物免疫的能力。合成两个鞭毛蛋白的22个保守氨基酸，分别命名为Flg22-1、Flg22-2。检测发现，Flg22-1与Flg22-2均具有激发植物免疫反应的功能，但Flg22-1激发能力显著强于Flg22-2。同样，Flg22-1与Flg22-2均能抑制拟南芥主根伸长，且Flg22-1抑制能力显著强于Flg22-2，这与第十九位氨基酸直接相关。荧光假单胞菌2P24只具有鞭毛蛋白FliC-1。fliC-1基因的突变导致2P24运动能力丧失。<br>　　菌株2P24与F113均具有T3SS。以菌株2P24为对象，构建T3SS结构基因rscQ-U的突变体。T3SS的突变显著增强了2P24的swimming、swarming能力，但对2P24的twitching没有显著影响，鞭毛数目没有改变。RNA-Seq检测发现，叶部接种2P24与2P24△rscQ-U后，本氏烟的转录组无显著差异，而根部接种2P24与2P24△rscQ-U后，拟南芥根系在转录组水平具有显著的差异表达基因。在接种6h后，2P24引起270个基因上调，230个基因下调;突变掉T3SS后，2P24引起的下调基因从230个增加到了1784个，上调基因从270个增加到了340个。在差异表达基因中，筛选到受2P24上调、突变掉T3SS后下调的基因共85个，通过q-PCR检测，确定至少有4个基因:JAZ10、ERF109、WRKY40、CML39受T3SS上调表达，这些基因与植物生长激素途径、生长发育相关的基因。这说明:T3SS可能参与了拟南芥根系的激素调节、生长发育。