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Wakhi人群的基因组多样性及其遗传源流分析

摘要Wakhi(瓦罕),是一个分居阿富汗、塔吉克斯坦、巴基斯坦和中国四国的种族。主要生活在阿富汗的瓦罕走廊、巴基斯坦北部的吉尔吉特-巴尔蒂斯坦地区、塔吉克斯坦的戈尔诺-巴达赫尚地区以及中国新疆的西南地区。在中国,Wakhi被官方归属于新疆塔吉克人(也称高山塔吉克,MountainTajiksinChina,XinjiangTajiks),在塔吉克斯坦,Wakhi也被公认为塔吉克人(Tajiks)。Wakhi使用印欧语系东伊朗次语支,这种语言也被新疆塔吉克人、塔吉克斯坦塔吉克人等作为方言使用。因此,在地理位置和语言使用上,Wakhi与塔吉克人十分相似。<br>  据史料记载,Wakhi原本是地名,与色勒库尔地区相连,两个地区的人民来往密切,增进了两地的文化交流和融合。在唐朝时期,Wakhi地区曾属于我国,当时由“鸟飞州都督府”管辖。之后,由于战乱等因素,Wakhi人群迁移到不同地区,其中就包括现在的新疆西南边陲地区。由此可见,Wakhi可能在历史上与XinjiangTajiks有着密切的联系。<br>  目前围绕Wakhi人群遗传学的研究非常少,主要的文献资料都是关于其历史文化,尤其是语言方面的研究。本课题主要从群体遗传学的角度研究Wakhi人群。前期使用PCA、FST、IBD方法分析Wakhi和XinjiangTajiks的遗传关系,再从群体杂合度、群体内部特异性方面进一步比较两个人群。中期进行了Admixture、Hapmix和Multiwaver系列分析,得出Wakhi两大祖源人群:西欧和南亚,据此建立Wakhi遗传混合模型,同时以XinjiangTajiks遗传混合模型作对照。综合以上结果,最终得出Wakhi和XinjiangTajiks是在遗传学上相似的两种人群的结论。后期一方面使用ArchaicSeeker检测了Wakhi基因组中古人片段渗入信号,将存在这些信号的区域作基因注释,发现大都和细胞信号转导有关,其中基因MAGI2可能是Wakhi在高原适应过程中受选择的基因。另一方面,以FST--iHS相结合的方法筛选出Wakhi明显区别于XinjiangTajiks的选择信号位点,同样作基因注释后发现Wakhi在基因EGLN3区域存在连锁遗传,其单倍型频率明显高于XinjiangTajiks及其他人群,说明Wakhi可能在该基因区域存在特殊的选择。

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导师 徐书华
学位信息:
中国科学院大学 生物学 计算生物学(硕士) 2019年
分类号 Q78
发布时间 2021-11-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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