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染色质结合蛋白PHD finger 14(PHF14)在肺癌中的作用和机制研究

摘要PHDfinger是一类通过识别特定修饰组蛋白尾端、调节染色质结合蛋白进而调节基因转录表达的重要结构功能域,广泛存在于真核生物中。PHF14作为一种PHDfinger蛋白,主要定位于细胞核中,可以与染色质结合,可能发挥表观遗传调控和转录调控的作用。先前的研究发现,PHF14在结肠癌和胆管癌细胞中缺失,敲低PHF14可以促进胆管癌细胞的增殖,说明PHF14可能作为tumorsupressor发挥对肿瘤的抑制作用。但是近些年越来越多的研究发现,PHF14在多种肿瘤中高表达,包括肺癌,胶质瘤,膀胱癌等,敲低PHF14可以显著抑制肿瘤细胞的增殖,我们实验室前期通过质谱的方法发现,PHF14可以与KIF4A形成复合物,两者协同调控了肺癌细胞的增殖,这些结果说明PHF14可能作为一个oncogene,促进肿瘤发生。然而,PHF14作为表观调控蛋白在肿瘤发生和发展中的作用和机制目前尚不清楚。为了探究PHF14在肺癌发生中的分子作用机制,我们首先采用全基因组层面的基因共表达分析策略,利用TCGA肺腺癌和肺鳞癌数据库,对PHF14的全基因组的共表达基因进行分析,研究发现Top20与PHF14显著共表达基因均定位于7号染色体短臂(7p)上,其中包括USP42,MRM2,ZNF12,TWISTNB等,更有意思的分析结果显示:1)多数基因与PHF14一样均定位于细胞核内;2)多数均在肺癌组织中显著高表达;3)PHF14及其共表达基因的拷贝数扩增与7p的扩增密切相关。不管在肺腺癌和肺鳞癌中,PHF14共表达基因中与PHF14相关性最高的都是USP42,生化和细胞实验证实,USP42可以稳定PHF14的蛋白水平,保护PHF14不被降解,USP42是PHF14的去泛素化酶,敲低USP42显著抑制肿瘤细胞的增殖,这与PHF14的功能一致,说明USP42与PHF14存在功能上的相关性。但是依然没有解决的问题是PHF14如何调控肿瘤发生,PHF14的高表达与7p的扩增有关,我们进一步分析了肺癌数据库中基因组的拷贝数变异情况,发现7号染色体短臂上存在7p11.2和7p22.3两个位点的扩增,7p11.2和7p22.3的共同扩增显著降低肺腺癌病人的生存时间。7p11.2上最重要的扩增基因是EGFR,而PHF14及其共表达基因都位于7p22.3的扩增位点上,经过分析发现,PHF14与EGFR的拷贝数相关性最高,暗示PHF14与EGFR可能存在功能上的相关性。我们在肺癌细胞中敲低PHF14的表达,发现EGFR的表达显著下调,并且EGFR下游信号通路受到抑制,但是对EGFR的mRNA水平的表达没有影响,在PHF14肝特异性敲除和肺特异性敲除的组织水平,也得到了同样的结果。敲低PHF14也可以显著抑制突变EGFR的表达,尤其在具有获得性抵抗T790M突变的细胞株中,提示靶向PHF14可以用于治疗TKI抵抗的肺癌病人。在EGFR受到配体激活所诱导的蛋白质降解的过程中,PHF14的表达也显著下调,另外在敲低PHF14,并抑制细胞蛋白降解途径后,EGFR的表达显著回升,说明PHF14可能参与调控EGFR的降解。对于PHF14是如何调控EGFR的蛋白水平的表达,需要进一步的探究。总之,PHF14对于肿瘤细胞增殖的调控,可能是通过对EGFR及其下游信号通路的调控实现的,PHF14可以为肺癌病人尤其是对TKI抵抗的肺癌病人提供新的靶点。

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导师 陈正军
学位信息:
中国科学院大学 生物学 生物化学与分子生物学(博士) 2020年
发布时间 2021-11-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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