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摘要蚊子是非常重要的病毒携带者，特别是在RNA病毒病原体的传递过程中起着重要的作用。尽管宏转录组等技术的发展可以填补蚊子相关病毒在进化中的空白，拓展对RNA病毒世界的认识，但是对于一个海岛这样封闭环境模型中，病毒群系的研究和病毒-宿主蚊虫在进化上的关系仍然缺乏足够的认识。因此，研究海南岛蚊虫相关病毒宏转录组不仅仅对于病毒群系和病毒-宿主共进化的有更加深刻的认识，也提供了病毒病原体潜在危害的监测和预警。<br>　　我们对采集自中国海南岛的主要蚊种携带的RNA病毒进行了大规模的宏转录组调查和研究。2018-2019年间，我们在海南岛的13个地区进行了采样，共计采集了3095只蚊子，分别属于23个蚊种，5个属。对在海南岛上广泛存在并且保存完好的13种蚊子进行宏转录组测序和生物信息学分析。总共检测到71种具有完整或者近似完整的病毒序列，这些病毒分别属于23个已知病毒科，以及4个可能的潜在新的科或者属。其中有47种病毒是首次被检测出来的新病毒。在13种被检测的蚊种中，白纹伊蚊是最主要的蚊子病毒携带者，其样本中检测病毒的数目和表达丰富度远高于其他蚊种携带的病毒。通过RNA病毒的表达丰度水平、是否与蚊子或者昆虫相关的病毒在进化树上相临近以及出现频度的标准，我们发现其中有41种病毒是蚊子相关的病毒。基于这些病毒我们发现病毒的系统发育关系能够反映其宿主的系统发育的拓扑结构，说明相对封闭的海南岛上蚊子相关的病毒与其宿主呈现共进化的关系。同时我们发现，黄病毒属中LaTinavirus存在2种变异的基因组结构。编码病毒不可或缺的RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)的NS5基因从正链多聚蛋白(polyprotein)中脱离并跳跃整合到其互补链上，说明正链RNA病毒的互补链不仅仅在病毒基因组复制的过程中发挥作用，也在蛋白翻译的过程中也起到重要的模板作用。此外，LaTinavirus与RNA病毒病原体具有相似的抗原性，因此被认为是潜在的人类病原体。我们还发现了3种黄病毒属RNA病毒，它们与LaTinavirus和其他病毒病原体在进化树上临近，它们也可能是潜在的人类病原体。<br>　　本研究对海南岛蚊虫携带的病毒群系进行了大规模的筛查，揭示了蚊虫病毒群系以及与宿主蚊子的进化关系。确定了影响蚊虫和病毒分布和发生的环境因素。初步建立了海南岛蚊子携带病毒的检测体系。这些研究结果对海南岛的蚊媒病毒的疾病控制和预防提供了重要的科学依据。