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癌症抑制因子ARID4B的结构生物学研究

摘要ARID4B蛋白又称为RBBP1L1,是癌症抑制因子RBBP1(也称ARID4A)的同源蛋白。二者都含有一个AT-richinteractiondomain(ARID),属于ARID蛋白家族。ARID4B和ARID4A作为转录因子,参与基因表达调控和表观遗传调控,在多种癌症的生长和转移中扮演着重要的角色。ARID4A与ARID4B的序列一致性较高,但是已有研究表明二者在功能上存在明显的差异。我们课题组已解析了ARID4ATudor结构域、chromobarrel结构域和PWWP-ARID结构域的三维结构,并研究了各个结构域的功能,然而ARID4B和ARID4A功能差异的分子机制尚不清楚。<br>  本课题中,我们重点研究了ARID4B的结构和功能。首先,我们利用NMR技术,解析了ARID4BTudor结构域的三维结构。通过分析ARID4A和ARID4BTudor结构域的结构差异,并结合NMR滴定及EMSA研究,证明ARID4B的Glu50与ARID4A的Leu50的残基差异导致ARID4BTudor结构域对DNA的亲和力更弱,蛋白质的热稳定性更强。此外,我们发现ARID4A和ARID4BTudor结构域C端具有一个保守的RGRmotif,该motif具有DNA结合能力并倾向于结合在AT-richDNA的小沟,从而提高蛋白对DNA的亲和力。<br>  我们还解析了ARID4BARID结构域的三维结构,并通过NMR滴定实验研究了ARID结构域与DNA和PWWP结构域的相互作用。ARID4BARID与DNA的结合界面位于α4、α5以及α4和α5之间的loop区,与PWWP结构域相互作用的界面位于α2和α6,这些相互作用的界面与ARID4A的PWWP-ARID结构域的研究结果较为类似。ARID4B和ARID4A这两个蛋白的ARID结构域之间的主要差异在于重组表达时,独立的ARID4BARID结构域可溶,而独立的ARID4AARID结构域不可溶。结合突变体实验和热稳定性研究,我们发现ARID4BARID结构域的Leu350和Phe353是维持蛋白质稳定性的关键氨基酸残基。此外,我们也发现ARID4Bchromobarrel结构域与DNA和甲基化的组蛋白尾巴的亲和力略强于ARID4Achromobarrel结构域。<br>  我们的研究结果为ARID4B的功能研究提供了结构基础,研究中发现的ARID4B和ARID4A之间的结构、相互作用和稳定性的差异有助于我们理解ARID4A和ARID4B功能差异的分子机制。

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学位信息:
中国科学院大学 生物学 生物化学与分子生物学(博士) 2021年
分类号 Q51
发布时间 2022-04-18
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