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Terriglobus roseus源新型木糖--1--磷酸胸苷转移酶的克隆表达、活性测定以及蛋白结构研究

摘要木糖是一种戊糖,为五碳醛糖,是木聚糖的组分之一,广泛存在植物细胞内,也存在糖蛋白、动物肝素和软骨素中。目前游离的木糖还未在自然界中发现,木糖相关的糖缀合物已被发现具有重要的生物学价值,如作为植物及细菌的细胞壁及细胞外多糖组成成分,提供细胞间的联系功能,参与细胞间信号传导与交流、细胞增殖、肿瘤细胞生长等。在木糖糖缀合物的合成过程中,需要大量的木糖核苷酸作为糖基供体,UDP-木糖是生物体内常见的九种核苷酸糖之一,在生物体的生化合成中发挥着不可替代的作用。在生物体核苷酸糖合成通路中,UDP-木糖的合成途径主要是:木糖经过相关激酶的催化作用,产生UDP-木糖合成所需的底物Xy1-1-P,Xy1-1-P在木糖-1-磷酸胸苷转移酶的催化下与UTP反应而生成UDP-Xy1。工业中常用化学法合成UDP-Xy1,但此法存在一些缺点,如步骤复杂,产量较低,成本较高等。用生物酶法方法合成UDP-Xy1具有操作简单、产物纯、成本低、产量高、对环境友好的优势,而采用这种方法需要具有高性能的生物酶。目前对上述通路中所需的木糖-1-磷酸胸苷转移酶的研究较少,本论文以Xy1-1-P到UDP-Xy1的合成通路中所需的糖-1-磷酸核苷转移酶为研究对象,挖掘具有高性能的木糖-1-磷酸胸苷转移酶并研究其活性特点及蛋白结构。<br>  本论文从Terriglobus roseus菌株中发现了拟葡萄糖-1-磷酸胸苷转移酶的基因,通过基因克隆、载体构建和体外诱导表达,获得了具有活性的酶,经过活性测定,发现其具有为木糖-1-磷酸胸苷转移酶的活性。接下来,对该酶的最适pH、最适温度等反应条件进行了研究,同时为了解释其催化机理,对其进行了蛋白结晶的条件筛选以培养合适的蛋白晶体,并对其三级结构进行了解析。具体研究内容如下:<br>  1.新型木糖-1-磷酸胸苷转移酶Tr0678的基因克隆、重组表达、纯化及活性测定研究<br>  通过生物信息学序列比对,本研究从酸杆菌门的Terriglobus roseus(DSM18391)中发现了编码葡萄糖-1-磷酸胸苷转移酶的基因:Tr0678。通过设计引物、PCR扩增、载体构建,获得了重组拟葡萄糖-1-磷酸胸苷转移酶的基因片段。将重组拟葡萄糖-1-磷酸胸苷转移酶质粒导入到大肠杆菌E.coli BL21(DE3)细胞中在18℃进行IPTG诱导表达,并使用镍亲和层析柱(Ni-NTA)对所得的带有组氨酸标签的重组拟葡萄糖-1-磷酸胸苷转移酶进行了分离和纯化。经凝胶电泳SDS-PAGE分析,结果显示,得到了纯度较高的目的蛋白的单一条带,且条带大小与理论分子量33kDa基本一致。采取改良型的Bradford蛋白浓度测定试剂盒对其蛋白浓度进行了测定,得到纯化后的拟葡萄糖-1-磷酸胸苷转移酶Tr0678的实际蛋白浓度为3.3573±0.25mg/mL。<br>  为了确定拟葡萄糖-1-磷酸胸苷转移酶的活性,以相关糖一磷酸包括Xy1-1-P作为底物,在反应体系中加入UTP,37℃进行反应,将反应结束后的上清液,使用液相质谱联用仪对反应产物进行检测。根据色谱条带及质谱峰图,初步判断Tr0678具有相关活性,通过分子量的大小,确定产物为UDP-Xy1,即Tr0678对Xy1-1-P有明显活性,确定其具有木糖-1-磷酸胸苷转移酶的活性。接下来,本研究继续以Xy1-1-P为底物,利用已经建立的LC-MS检测法,对该木糖-1-磷酸胸苷转移酶的基本酶学特性进行了研究。结果表明:该酶的最适反应pH条件为8.0,最适反应温度条件为50℃,且在37-50℃之间能保持较高活性。<br>  2.新型木糖-1-磷酸胸苷转移酶的活性位点、蛋白结晶条件筛选及结构解析研究<br>  选取具有类似功能的糖-1-磷酸核苷酰转移酶基因序列,通过同源蛋白序列比对,将其中的保守位点第108位天冬氨酸进行定点突变,使其突变成丙氨酸及天冬酰胺,通过比较对突变体与野生型Tr0678的相对酶活力,发现对位于第108位的天冬氨酸突变后,其相对酶活性几乎丧失。因此判断Asp108是影响Tr0678木糖-1-磷酸胸苷转移酶催化活力的关键氨基酸。<br>  通过对Tr0678蛋白的大量表达与纯化,得到了纯度较高的蛋白溶液,并通过结晶条件的初步筛选,在pH为5.0的0.1M柠檬酸缓冲液,沉淀剂为20%(v/v)及PEG6000条件下获得了突变型蛋白晶体。在野生型蛋白初筛条件的基础上,更换蛋白缓冲液为pH为6.5的柠檬酸-硫酸钠缓冲液,并通过降低浓度进行优化,获得了优化的野生型蛋白晶体。通过添加1%的底物,将野生型及突变型Tr0678与底物进行共结晶,获得了复合物晶体。经X光衍射蛋白晶体分辨率为2.65(A)。收集整理衍射数据并进行分析,解析出了Tr0678的蛋白结构,以该结构为模板预测了突变体与底物复合物的结构。结果发现该蛋白的一个活性单元为该蛋白的一个二聚体,两个蛋白分子以“头尾相对”方式结合。对于该酶的催化机制还有待进一步的研究。

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分类号 Q555(酶)
发布时间 2022-05-27(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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