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摘要研究目的<br>　　1.了解2016年9月-2018年8月间广东省活禽市场中不同亚型禽流感病毒的污染和分布情况。<br>　　2.阐明广东省活禽市场禽流感病毒的主要来源，本文主要探究H3N2亚型禽流感病毒基因重配情况。<br>　　3.监测禽流感病毒的变异情况，本文主要研究H5N6亚型禽流感病毒血凝素基因变异情况。<br>　　研究方法<br>　　1.病原学监测。广东省21个地级市流感监测网络实验室以城乡活禽市场为主要监测点，采集环境样本和活禽样本，进行甲型和H5、H7、H9分型检测。对广东省21个地级市监测点的数据进行流行病学的描述性研究，初步掌握禽流感病毒在外环境的污染状况。<br>　　2.病毒分离鉴定。对禽流感病毒阳性样本进行鸡胚分离培养，再经红细胞凝集试验、核酸提取、PCR扩增、毛细管电泳鉴定后，在PGM平台进行测序和拼接，获得病毒基因序列。<br>　　3.生物信息学分析。使用theIonPGMsystem以及CLCGenomicsWorkbenchv7.51进行数据处理和序列拼接，使用BioEditv7.1.3进行序列编辑、同源性分析等，使用Muscle3.8.31进行序列比对，使用iqtreev1.6.3建立MaximumLikelyhood系统发育进化树，使用FigTreev1.4.2以及AdobeIllustratorCS5对进化树进行编辑和优化。<br>　　研究结果<br>　　1.2016年9月-2018年8月间，以广东省21个地级市的活禽市场为主要监测场所，采集环境和活禽样本共计51054份，禽流感病毒检测结果阳性9390例，阳性率为18.39％。<br>　　2.阳性样本接种鸡胚总数3887个，获得1132株禽流感病毒分离株，分离率29.1％。经测序获得各亚型病毒序列和数量如下:主要为H5N6(73株)、H7N9（77株）、H9N2（220株），以及H1N3(1株)、H3N2(7株)、H3N3(1株)、H3N6(5株)、H3N8(4株)、H3N9(1株)、H5N2(2株)、H6N2(24株)、H6N6(54株)、H9N9(1株)。<br>　　3.7株H3N2亚型禽流感病毒均为出现了抗原性漂变的重配病毒，其基因节段来源主要为禽源H3N2亚型，H1N2亚型次之。73株H5N6亚型禽流感病毒红细胞凝集抑制试验、血凝素基因系统进化树、及其氨基酸分析的结果均显示，与疫苗株Re-8相比，2017-2018年广东省流行的H5N6病毒出现了抗原性漂移。<br>　　研究结论<br>　　2016年9月-2018年8月间，广东省活禽市场中禽流感病毒阳性率高(18.39％)，阳性样本中包含的禽流感病毒亚型多(13种)，其中以H9N2亚型为主。协助构建广东省以活禽市场为来源的禽流感病毒库。证实广东省活禽市场中存在H3N2亚型禽流感病毒，并阐明了其基因重配的情况。2017年7月实施疫苗政策后，H7亚型禽流感病毒阳性率迅速下降，H5亚型禽流感病毒阳性率没有明显变化，2017-2018年广东省流行的H5N6病毒出现了抗原性漂移。以上结果可为广东省的禽流感防控工作提供依据。