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拟南芥花期调控相关染色质调控因子的结构生物学研究

摘要花期调控是被子植物由营养生长向生殖生长过渡阶段重要的调控过程。植物能够对多变的内外环境,做出及时、准确的响应,从而实现精准的花期调控。在兼性长日照植物拟南芥中,光周期途径、春化途径、赤霉素途径等多种调控途径协同作用,形成复杂的基因调控网络,确保植株能在合适的内外部条件下开花,以实现最大的生殖效益。而在各类花期调控途径中,为数众多的染色质调控因子,对花期的精细调控起着关键的作用。染色质调控因子可以通过组蛋白的修饰与去修饰、组蛋白变体的替换、染色质重塑等多种表观遗传机制直接影响染色质状态;或通过募集其他染色质调控复合物,间接改变染色质状态。染色质调控因子通过改变关键调控位点的染色质状态,影响开花基因表达,从而实现花期的精准调控。<br>  在本论文中,我详细介绍了博士期间关于三类拟南芥花期调控相关染色质调控因子的研究工作,并从结构、生化、遗传三个层面,对这三类蛋白进行阐述。<br>  首先,我们对拟南芥组蛋白去甲基化酶JMJ13开展了结构与功能研究。我们首先在体内和体外,分别证明了JMJ13是H3K27位点特异性的组蛋白去甲基化酶。我们进而解析了JMJ13CD-α-KG和JMJ13CD-NOG-H3K27me3复合物的晶体结构,并阐明了JMJ13催化组蛋白去甲基化反应和底物特异性识别的分子机制。进一步的合作研究发现,拟南芥JMJ13是一个光周期和温度依赖的开花抑制因子,通过GI/CO途径和SVP/FLM途径调控花期。<br>  其次,我们开展了拟南芥春化过程相关的三个B3超家族蛋白的结构与功能研究。我们首先解析了VAL1B3-DNA、FUS3B3-DNA、LEC2B3-DNA的晶体结构,并通过比较发现,这三个LAV家族B3蛋白能通过相似的DNA结合方式和保守的氨基酸,参与5''-TGCATG-3''基序的特异性识别。进一步的合作研究发现,在拟南芥春化过程的不同阶段,不同B3蛋白可以在FLC位点CME区参与竞争结合,调控FLC位点不同染色质状态的建立,并发挥着相互拮抗的生理功能。<br>  最后,我们揭示了拟南芥转录抑制因子TEM1的结构与功能机制。TEM1包含AP2和B3两个DNA结合结构域。我们分别解析了TEM1AP2-DNA和TEM1B3-DNA的晶体结构,并详细阐释了TEM1特异性识别DNA的分子机制。进一步的生化和遗传研究发现,TEM1同时依赖AP2和B3两个结构域,参与FT5''-UTR的识别。同时,TEM1通过与PRC2复合物核心组分CLF互作,参与FT位点的染色质调控,进而影响花期。<br>  我们重点从结构生物学和生物化学的角度出发,以蛋白及其复合物为着眼点,研究各类染色质调控因子在花期调控过程中发挥作用的分子机制,与经典遗传学研究手段相辅相成。我们的研究,对进一步探索拟南芥花期调控过程中染色质因子的调控机制,有着重要的参考价值。

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导师 杜嘉木
学位信息:
中国科学院大学 生物学 生物化学与分子生物学(博士) 2021年
分类号 Q945.64
发布时间 2022-10-20(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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