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MED16与转录因子UBP1\TFCP2的相互作用以及功能研究

摘要转录中介体复合物(MediatorComplex)是真核生物转录过程中极其重要的一种“共激活因子”。尽管人们已经初步理解转录因子是通过招募转录中介体复合物进而招募RNA聚合酶Ⅱ去起始基因转录的,但仍有一部分转录因子连同转录中介体复合物在基因启动子区的结合起着抑制转录的作用,而这背后的机制却鲜为人知。在本文的研究当中,我们发现了转录中介体复合物MED16亚基能够结合转录因子UBP1和TFCP2,这种相互作用能够促进其下游靶基因的转录,却又能够抑制HIV-1病毒的表达。结合免疫共沉淀、凝胶过滤层析以及质谱蛋白质组学分析,我们发现MED16能够游离于转录中介体复合物之外,与UBP1、TFCP2、YY1共同形成约250KDa大小的复合物。通过RNA-Seq分析,我们发现MED16与UBP1共同调控肺部发育与稳态、血管生成相关基因的表达。相反的,MED16和UBP1虽然也能够结合在HIV-1的启动子区,但却抑制了HIV-1病毒的转录进而增强了病毒的潜伏性。通过序列比对我们观察到:UBP1在HIV-1启动子区结合的位点恰巧是其转录起始位点。利用生物素标记的体外转录实验,我们发现MED16及转录中介体复合物被招募至此反而会影响转录预起始复合物发挥功能,造成CDK8结合减弱、通用转录因子TFIIB结合增强、RNA聚合酶ⅡCTD磷酸化异常,最终导致转录起始受阻。本工作发现了MED16能够与UBP1、TFCP2相互作用,并根据基因上结合的相对位置不同起着相反的作用,提示了转录因子相对位置对基因调控的重要性。为人类进一步了解真核生物转录调控、器官发育、HIV-1的潜伏机制提供了分子生物学基础。

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导师 王纲
学位信息:
中国科学院大学 生物学 生物化学与分子生物学(博士) 2022年
分类号 R33
发布时间 2023-01-04
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