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LUBAC介导RabGEF1的线性泛素化修饰研究

摘要研究背景:蛋白质的泛素化(ubiquitination)修饰是一种重要的翻译后修饰,参与多种细胞生物学活动。泛素是一种小分子蛋白质,能够以单个或以聚合链的形式结合在底物蛋白上进行修饰,由此泛素化修饰可以分为单泛素化修饰和多泛素化修饰。泛素化修饰是一个复杂的过程,由泛素活化酶ubiquitin-activatingenzymes,E1)、泛素结合酶(ubiquitin-conjugatingenzyme,E2)、泛素连接酶(ubiquitinligase,E3)级联催化泛素分子共价结合在底物分子上以调节蛋白质功能。泛素有7个赖氨酸(Lys)残基(Lys6,Lys11,Lys27,Lys29,Lys33,Lys48和Lys63),之前的研究发现泛素化修饰是通过这的7个Lys残基之一产生的,近年来发现了一种新的泛素化修饰是通过泛素N末端的甲硫氨酸(Met)残基形成的,称为线性泛素化修饰(1inearubiquitinmodification)。线性泛素链组装复合体(1inearubiquitinationassemblycomplex,LUBAC)是迄今为止唯一己知的可以催化线性泛素化的泛素连接酶,由催化亚基HOIP和两个调节亚基SHARPIN、HOIL-1L所组成。目前的研究发现线性泛素化修饰在核因子-κb(NF-κB)和丝裂原活化蛋白激酶(MAPKs)的激活,选择性自噬,巨噬细胞的炎症小体激活,干扰素信号等有关先天和适应性免疫中发挥重要作用,LUBAC中任何一个亚基的功能缺失会在小鼠模型或人类身上引起炎症、免疫缺陷甚至胚胎死亡。线性泛素化修饰具有重要的生物学功能,但目前鉴定到的底物不多,本研究以线性泛素链组装复合体UJBAC为切入点,通过研究HOIP互作蛋白的方式探寻新的线性泛素化修饰底物,进一步研究其生物学功能。<br>  研究目的:验证RabGEFl(Rabguaninenucleotideexchangefactor1)为线性泛素化修饰的新底物。<br>  研究方法:通过BioGRID数据库筛选,从中选取了LUBAC的催化中心HOIP的相互作用蛋白——RabGEF1蛋白。通过PCR技术,扩增得到RabGEF1基因片段,经EcoRI和BamHI两种限制性核酸内切酶酶切,得到具有相同酶切位点的RabGEF1基因片段和pEF6/Myc-HisC载体,通过无缝连接体系,在pEF6/Myc-HisC载体中插入了人RabGEF1基因片段,构建了pEF6/Myc-RabGEFl质粒,方便后续实验。通过免疫共沉淀实验(Co-IP)验证RabGEFl和HOIP的相互作用。利用GST-pulldown实验探索RabGEF1与HOIP相互作用结构域。通过免疫荧光实验验证毗LbGEFl和HOIP的相互作用与亚细胞定位。应用体内泛素化实验检测RabGEFl的线性泛素化修饰。将RabGEFl的泛素化蛋白样品进行质谱分析,根据质谱结果提示的RabGEF1泛素化位点构建RabGEF1泛素化赖氨酸位点突变质粒,利用RabGEF1点突变质粒在体内泛素化实验中验证RabGEFl的泛素化修饰位点。<br>  研究结果:我们发现RabGEF1与HOIP存在相互作用,且HOIP通过ZF-NEF结构域与RabGEF1发生直接相互作用。RabGEF1与HOIP共同定位于细胞质。LUBAC介导RabGEFl发生线性泛素化修饰依赖于LUBAC酶活性,nbGEF1泛素化修饰位点为K158。<br>  研究结论:RabGEF1为线性泛素化修饰的新底物,且K158是其发生线性泛素化修饰的位点。

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