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LRRC31在前列腺癌中的表达及临床意义

摘要目的探讨富含亮氨酸的重复序列蛋白(leucine-richrepeat-containingprotein31,LRRC31)在前列腺癌(Prostatecancer,PCa)组织及正常前列腺组织中表达水平是否有差异及其对前列腺癌患者的临床意义,探讨LRRC31的表达水平与前列腺癌患者肿瘤分期、临床分级以及总生存时间的相关性,进一步探寻LRRC31对于前列腺癌的作用途径。<br>  方法首先利用美国癌症基因组图谱数据库(TheCancerGenomeAtlas,TCGA)以及Genotype-TissueExpression(GTEx)数据库下载并分析LRRC31在多个肿瘤组织中的表达水平是否有差异,并通过TheHumanProteinAtlas(THPA)数据库检索LRRC31在人亚细胞结构中的定位;然后用TCGA+GTEx联合分析前列腺癌组织与正常前列腺组织中LRRC31的表达是否有差异,同时分析LRRC31的表达水平与前列腺癌患者的临床病史特点的相关性(包括患者的肿瘤分期、临床分级及生存时间);最后运用多个数据库对共表达网络进行KEGG信号通路富集分析、RNA修饰基因分析、免疫检查点分析、免疫细胞浸润分析、突变景观分析。采用Perl5.34.0及R4.0.5统计软件对相关数据进行处理。<br>  结果LRRC31在多种肿瘤组织中均有异常表达,LRRC31在人细胞中主要位于细胞核内,LRRC31在前列腺癌组织中的表达水平相较于其在正常前列腺组织中的表达水平显著升高(p=0.022);LRRC31的表达水平与前列腺癌患者的TNM分期以及临床分期的差异无统计学意义(p值分别为p=0.38、p=0.85、p=0.65、p=0.87);低表达LRRC31的前列腺癌患者的总生存期明显优于高表达LRRC31的前列腺癌患者(p=0.02)。纳入多个因素对LRRC31进行COX回归分析发现LRRC31不能作为独立的预后因子。根据基因表达谱的基因富集分析(GeneSetEnrichmentAnalysis,GSEA)的结果表明,LRRC31可能通过多种细胞代谢途径及细胞通路影响前列腺癌的发生,包括谷胱甘肽代谢,Notch信号通路,苯丙氨酸代谢,RIG-Ⅰ样信号通路,RNA降解,小细胞肺癌及泛素介导的蛋白水解途径;RNA修饰基因分析结果显示m1A消码器ALKBH1及m6A编码器WTAP与LRRC31相关性显著(p<0.05);免疫检查点分析结果显示在抑制免疫检查点相关基因中,LRRC31与前列腺癌中的大多数免疫调节剂呈负相关(p<0.05);免疫细胞浸润分析结果说明LRRC31与B细胞、CD8+T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞(dendriticcell,DC)的相关性显著(p<0.05);突变景观图显示突变显著并且突变频率最多的为TP53(突变频率22.7%,p<0.05),其次突变显著的为SPOP(突变频率21.5%,p<0.001)。<br>  结论相较于正常组织,LRRC31在前列腺癌中高表达,且提示前列腺癌患者预后不良,并可通过多种途径影响前列腺癌的发生及发展。

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导师 徐忠华
分类号 R737.25
发布时间 2023-04-26
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