检索历史 清除

摘要第一部分运用生物信息技术筛选并分析肾透明细胞癌的关键候选基因<br>　　目的:运用生物信息技术，筛选肾透明细胞癌(clearcellrenalcellcarcinoma，ccRCC)关键候选基因，为后续研究奠定基础。<br>　　方法:在TCGA数据库中筛选出肾透明细胞癌关键预后基因。运用R软件的clusterProfiler包对预后相关基因进行功能注释和通路富集分析(GO和KEGG分析);从GEO数据库中筛选出GSE53757、GSE68417、GSE66272三个数据集与TCGA数据库数据并下载其基因表达谱，使用R软件筛出ccRCC差异表达的基因;分析TCGA数据库中与肾透明细胞癌的TNM分期相关的基因;三者取交集得到同时与肾透明细胞癌的发生、TNM分期、预后相关的基因。分析同时与肾透明细胞癌的发生、TNM分期、预后相关的基因，选择在ccRCC中高表达且与预后良好相关的SPATA18(spermatogenesis-associated18)，使用TCGA、CPTAC数据库初步探究SPATA18在ccRCC的表达与价值。<br>　　结果:从TCGA数据库中筛选出与肾透明细胞癌预后相关性风险比最强的40个基因，这40个基因富集的通路为脂肪酸的代谢、氨基酸降解、PPAR信号传导途径、甲状旁腺激素的合成分泌和作用、碳代谢六个通路;从GEO数据集及TCGA数据库筛选出在肾透明细胞癌组织和正常肾组织差异表达基因1046个，与T、N、M分期相关的基因有2956个。预后相关基因同时和肾透明细胞癌的发生、TNM分期相关的基因有SPATA18、G6PC和IL20RB三个，其中关键基因SPATA18mRNA的表达与ccRCC良好的预后相关性最强，因此选取SPATA18作为进一步研究基因。SPATA18在ccRCC患者中高表达，SPATA18mRNA的表达与ccRCC的组织学分级、临床分期、T分型和远处转移相关。高SPATA18表达与良好的总生存率相关。多因素分析显示，SPATA18是ccRCC预后的独立危险因素，具有良好的预后判断价值。<br>　　结论:运用生物信息技术有助于筛选关键候选基因并分析其功能，为后续研究提供参考及方向，SPATA18是ccRCC关键预后基因，选择SPATA18进一步分析并验证。<br>　　第二部分SPATA18蛋白在肾透明细胞癌中的表达及临床意义<br>　　目的:探究肾透明细胞癌组织中SPATA18的蛋白表达水平及其临床意义。<br>　　方法:收集苏州大学附属第二医院90例ccRCC患者的组织标本及69例癌旁正常组织标本。通过免疫组织化学法检测SPATA18蛋白在肾透明细胞癌与癌旁正常肾组织中的表达水平;收集患者临床资料，分析SPATA18表达情况与肾透明细胞癌AJCC临床分期、WHO/ISUP病理分级的相关性，验证SPATA18在肾透明细胞癌中的诊断价值。对患者生存情况进行随访，将患者分为高SPATA18表达组和低SPATA18表达组，统计分析两组患者生存情况与SPATA18表达强度的关系，验证SPATA18的预后价值。<br>　　结果:免疫组化结果显示肾透明细胞癌组织中SPATA18蛋白的表达水平高于癌旁正常肾组织。临床分期(AJCC临床分期)Ⅰ期和Ⅱ期患者的SPATA18的表达水平高于Ⅲ期和Ⅳ期患者，病理分级(WHO/ISUP)Ⅰ级和Ⅱ级患者的SPATA18的表达水平高于Ⅲ级和Ⅳ级患者。患者总生存期随访数据分析表明SPATA18的高表达患者组总生存期优于低SPATA18表达的患者组。<br>　　结论:肾透明细胞癌组织中SPATA18蛋白水平显著升高。在不同的临床分期、病理分级中SPATA18的表达具有显著差异，提示其具有一定的预后判断价值。