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摘要目的:本研究旨在构建我国玄参药材的遗传分析和品质评价体系，通过分析不同玄参种质资源化学成分差异和遗传组成特征，经同圃栽培后，探究非环境因素对玄参药材品质变异的影响，为玄参种质遗传分析和品质评价及新品种选育提供参考。<br>　　方法:1.应用非靶向代谢组学和HPLC技术，探索不同加工方式玄参药材中化学成分的含量变化，构建统一的玄参药材加工方法。2.应用SRAP分子标记和SSR分子标记对不同玄参种源进行遗传组成分析。3.应用Mantel统计分析不同玄参资源遗传距离和化学成分变异之间的相关性。4.基于HPLC指纹图谱数据分析不同种源、不同块根部位、不同块根重量导致的玄参药材品质变异。<br>　　结果:1.玄参块根统一加工方法的构建及代表性化合物筛选<br>　　不同加工方式获得玄参药材，其化学成分组成有显著的差异。基于非靶向代谢组学数据分析明确了加工过程中主要化学成分的变化，结合已有研究确定了环烯醚萜类和苯丙素类药效成分哈巴苷、哈巴俄苷、桃叶珊瑚苷、毛蕊花糖苷、安格洛苷C、肉桂酸，为代表性指标成分，并构建了检测上述6种成分的HPLC技术体系。分析了不同加工方式对玄参药材中六种主要化学成分变化的影响，结果表明，60℃烘至恒重与传统加工方式得到的块根化学物质组成最为近似，药材性状符合药典规范且步骤简单效率较高的玄参药材前处理方法。<br>　　2.不同玄参种源的遗传组成分析<br>　　构建了基于UPGMA和PCoA聚类分析的玄参种源遗传特征的研究方法。两种标记基于UPGMA的聚类分析和PCoA主坐标分析均将浙江产区的玄参和中国西南主产区的玄参种源明显分为两组。两个主产区之间的种源遗传距离范围为0.3882～0.6178(SRAP);0.3747～0.7188(SSR)。本研究中我国栽培种玄参种源的遗传距离为0.0445～0.8348(SRAP),0.0000～0.9062(SSR);野生种源的遗传距离为0.6348～0.7130(SRAP),0.8125～0.8750(SSR);野生种源与栽培种源之间的遗传距离为0.3505～0.6178(SRAP)，0.2469～0.5754(SSR)。本研究中玄参群体总杂合度Ht为0.2733(SRAP)，0.2508(SSR);总体遗传分化系数Gst为0.2198(SRAP),0.3638(SSR);基因流Nm为2.8076(SRAP),1.3333(SSR)。<br>　　3.非环境因素导致的玄参药材化学成分变异分析<br>　　对比分析同圃栽培的不同种源玄参的化学组成，结果显示玄参完整块根中18个HPLC特征峰面积比块根中部6个活性成分含量能够更好地区分不同地区玄参药材，进而构建了基于18个HPLC特征峰面积的玄参药材品质变异系数分析技术体系。对同圃栽培的不同种源玄参药材的品质变异分析表明，我国不同种源玄参的化学成分变异系数为93.62％,统一其药材种源、控制其取材部位、统一的药材重量可使玄参药材的化学成分变异系数降低至38.43％。Mantel分析显示，不同种源玄参之间的遗传距离与18个HPLC特征峰面积的欧氏距离矩阵显著正相关(r=0.7196,p＜0.05),表明玄参种源遗传差异是导致化学成分差异的重要因素，种源间遗传距离越远化学成分差异越大。引起玄参药材化学成分差异的主要非环境因素有种源差异、药材取样部位差异、块根重量。<br>　　结论:(1)哈巴苷、哈巴俄苷、桃叶珊瑚苷、毛蕊花糖苷、安格洛苷C、肉桂酸可作为分析不同加工方式玄参药材的指标成分。与传统加工方式对比，60℃烘干的玄参药材中6个指标成分含量最为相似，性状符合药典规定且加工效率较高。(2)本研究中我国浙江地区和中国西南地区玄参种质资源遗传距离为0.3882～0.6178(SRAP);0.3747～0.7188(SSR);栽培种与野生种的遗传距离为0.3505～0.6178(SRAP),0.2469～0.5754(SSR)。(3)引起玄参药材化学成分差异的主要非环境因素有种源差异、药材取样部位差异、块根重量。同圃栽培的我国不同种源玄参药材其化学成分变异系数达到93.62％，通过筛选相同种源、控制其取材部位、统一的药材重量可使同圃栽培玄参的化学成分变异系数减少至38.43％。