检索历史 清除

摘要第一部分基于生物信息学研究HMGA2基因与AML的关系<br>　　目的:利用生物信息技术分析急性髓系白血病（acutemyeloidleukemia，AML）患者和健康人HMGA2基因表达的差异及其与RNA修饰、免疫调控基因的关系，并进行生存分析来探索HMGA2在AML中的预后意义。<br>　　方法:在基因表达数据库（TCGA、TARGET、GTEx）中提取AML与ENSG00000149948（HMGA2）基因相关表达数据，采用R语言对AML患者及健康对照组中HMGA2基因的表达水平进行统计分析,Kaplan-Meier法分析HMGA2基因表达水平与患者生存率的关系;提取44个三类RNA修饰（m1A（10）、m5C（13）、m6A（21））基因的标记基因，并计算了这些基因与HMGA2基因之间的Pearson相关性，进一步分析了HMGA2基因与五种免疫途径标记基因之间的关联。最后，我们利用R语言评估了HMGA2基因与AML免疫浸润之间的相关性。<br>　　结果:HMGA2基因在AML患者中的表达水平显著高于健康对照组（P＜0.05）。HMGA2高表达组的总生存率显著低于低表达组（P=0.01）。此外，HMGA2基因表达与DNA甲基化过程中的写入酶（writer）、读取蛋白（reader）和擦除酶（eraser）呈正相关。在儿童白血病样本中，HMGA2的表达水平与间质成分的丰富程度呈负相关;然而，在成人白血病样本中，这种关系并没有统计学意义。<br>　　结论:HMGA2基因在AML患者中高表达，其表达水平和预后呈负相关。HMGA2基因与DNA的甲基化相关。<br>　　第二部分HMGA2基因在AML患者中的表达水平及预后意义<br>　　目的:通过实时荧光定量PCR技术（qPCR）检测非M3型初发急性髓系白血病（AML）患者的HMGA2基因表达水平，探究HMGA2基因在AML患者中的表达特点及其与临床特征和预后之间的相关性。<br>　　方法:本研究随机纳入2018年1月至2023年6月于常州市第一人民医院诊治的AML患者92例。收集患者初诊时包括年龄，性别，血细胞计数，乳酸脱氢酶(LDH)水平，骨髓原始细胞计数，法美英(French-American-British，FAB)分类，融合基因，染色体及白血病靶基因二代测序结果在内的详细临床资料。后续追踪这些患者的临床预后。对照组10例，包括6例过敏性紫癜及4例健康供者。采用实时荧光定量PCR技术检测HMGA2基因在初发时骨髓标本及对照组中的表达水平。通过两独立样本的秩和检验(Mann-WhitneyUTest)、卡方检验和Fisher精确概率法分析HMGA2高表达组和HMGA2低表达组临床特征的差异,Log-rank检验和Cox回归模型分析影响预后的因素。<br>　　结果:在92例患者中，排除的标本不合格3例后剩余89例，其中9例(10.1％)患者HMGA2基因表达阴性，80例(89.9％)患者HMGA2基因表达阳性。相比于对照组,HMGA2基因在AML患者中的表达更高(P＜0.05)。80例AML患者根据cut-off值分为HMGA2低表达组30例(37.5％),HMGA2高表达组50例(62.5％)。相比于HMGA2低表达组，HMGA2高表达组的乳酸脱氢酶水平更高(P=0.026),遗传学核型突变比例更高(P=0.047),TP53突变率更高(P=0.036)、ELN预后良好组更少(预后良好vs预后中等:P=0.010;预后中等vs预后不良:P=0.442;预后良好vs预后不良:P＜0.01)。80例患者中37例(45.3％)患者获得CR,HMGA2低表达组和HMGA2高表达组的CR率分别为60.0％(18/30)和38.0％(19/50),具有统计学差异(P=0.018)。HMGA2低表达组中位总生存时间(OverallSurvival,OS)为575.0天，HMGA2高表达组中位OS为223.0天，HMGA2高表达组的中位OS明显缩短(P＜0.05)。单因素分析结果显示年龄≥60岁(P＜0.001)、预后良好相对于预后不良分层(P=0.013)、HMGA2高表达(P=0.027)是AML患者OS的危险因素。多因素分析结果显示仅年龄≥60岁(P＜0.001)是影响患者OS的独立危险因素。<br>　　结论:HMGA2在AML患者中的表达水平显著高于对照组。相比于HMGA2低表达组，HMGA2高表达组的乳酸脱氢酶水平更高、染色体突变率更高、TP53基因突变检出率更高、预后良好比例更低、CR率更低。HMGA2高表达组的OS更短，预后不佳。