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化学信息中知识挖掘的工具-中药分子结构数据库及其检索系统

摘要在建立分子结构检索系统时,该文研究了三个方面的问题:结构数据在数据库中的存储、子结构匹配以及检索系统平台的设计和实现.该文利用了Oracle数据库的面向对象特性,建立了用于表达和存储分子结构信息的对象关系数据模型,并利用此模型建立了乙酰胆碱酯酶抑制剂分子结构数据库和中药成份结构数据库.在子结构检索方面,采用了较为新颖并且高效的VF算法作为二维子结构匹配算法,并用Java语言编程实现了该算法,算法程序以存储过程的形式加载到Oracle数据库中,实现了数据库内部的子结构匹配功能.该文采用JSP和JavaBeans技术设计和实现了基于Web的子结构检索系统,提供了图形化的结构输入和显示界面,在检索系统中使用了CML作为应用程序与分子结构数据库之间数据交换的格式.此外,该论文还完成了一个小型的中成药数据库,它由中成药方、药用植物和辨证论治工具三个部分组成,并且设计和开发了用于Windows平台的检索和显示软件.中成药数据库和中药成份结构数据库构成了一个相对完整的中药信息系统,其中既包含了中成药方的信息,也包含了分子结构信息.

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