野油菜黄单胞菌不同地域分离株基因组结构与表型分析-论文-万方医学网

野油菜黄单胞菌不同地域分离株基因组结构与表型分析

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摘要对已完成全基因测序的两个野油菜黄单胞菌菌株Xcc 8004和XccATCC33913的基因组结构进行分析,结果表明在编码蛋白水平上,两个基因组达97.5％的同源性,而在基因组大小、结构上存在一定差异.主要差异包括:(1)8004的基因组比33913大72,538bp;(2)基因组结构上存在一个大片段、两个小片段倒置重排,以及一个移位重排;(3)8004中有两个菌株特异基因岛(giX8-a、giX8-b),33913有一个菌株特异基因岛(giX3-a);(4)8004在白萝卜白沙南畔洲晚萝卜栽培种上的相对致病力比33913高.以8004及33913基因组结构为参照,采用PCR及Southern blotting方法对20株中国不同地域Xcc分离菌株的基因组进行分析,结果表明所有菌株基因组里都含有与Xcc 8004和33913相似的致病相关基因簇(gum、hrp、LPS、type Ⅱ secretory system).而在基因组结构上,不同地域分离株与8004或33913都存在一定差异,所有中国菌株都未检测出对应的8004-33913染色体重排接口,也没有giX8-b和giX3-a基因岛,只有3株中国菌株(1号、3号和11号)含有与giX8-a相似的基因岛结构.主要表型检测表明,菌株间在EPS产量和致病力等方面均存在较大差异,这些表型与基因岛的存在没有明显相关性.该研究结果提示野油菜黄单胞菌在基因组结构进化方面存在较大的可塑性,而在致病相关基因簇方面具有一定的保守性.